Description entreprise :
L'Ecole normale superieure de Lyon produit une recherche de haut niveau dans ses 25 laboratoires et forme par la recherche quelque 2500 etudiants dont 500 doctorants. Elle compte environ 550 enseignants, enseignants-chercheurs et chercheurs et 600 personnels administratifs et techniques. Dans le classement de Shanghai et QS, elle se classe au 1er rang des etablissements francais en termes de performance per capita. Son objectif est d'avoir un impact significatif en matiere de recherche, d'innovation et de transfert de technologie tout en irriguant la fonction publique et le monde socio-economique de diplomes rompus a la complexite, capables de produire et transmettre des savoirs. L'ENS de Lyon met ses ressources au service d'une vision ouverte de la societe et des enjeux contemporains qu'elle veut eclairer. L'Ecole normale superieure de Lyon est implantee sur 112 829 m2 repartis sur 2 sites tres proches l'un de l'autre : Rene Descartes (siege) et Jacques Monod. Elle dispose ; d'une bibliotheque Diderot de Lyon (1,2 million de volumes disponibles sur le site Rene Descartes) proposant des collections en SHS (site Descartes), en sciences exactes et experimentales (site Monod) et en education (site Descartes). d'un theatre : la salle Kantor ; d'un studio de cinema : la salle Jean-Claude Carriere ; de deux salles de musique ; de deux gymnases de deux restaurants : un sur le site Descartes et un sur le site Monod. Son budget annuel est d'environ 150 M EUR. L'ENS de Lyon est une ecole dynamique, ou la qualite de vie et des conditions de travail, le developpement durable et l'egalite professionnelle representent des dimensions centrales.
Description du poste :
CONTEXTE : L'equipe DAMM est l'une des 15 equipes affiliees au Laboratoire de Biologie et Modelisation de la Cellule (LBMC) situe a l'Ecole Normale Superieure de Lyon. Le projet de recherche vise a ameliorer les systemes d'administration d'ARN messager (mRNA) a l'aide de simulations de dynamique moleculaire a gros grains (CG-MD), d'apprentissage machine (ML) et de modelisation integrative. Les travaux sont realises dans un environnement interdisciplinaire, en collaboration avec des experts en chimie computationnelle, biophysique et intelligence artificielle, a l'interface entre monde academique et industriel. MISSIONS & ACTIVITES DU POSTE : Notre groupe recherche un ingenieur d'etude pour contribuer a un projet de recherche de pointe portant sur la modelisation computationnelle, les nanoparticules lipidiques (LNP) et le developpement de solutions d'administration de medicaments assistees par l'IA. L'ingenieur travaillera en autonomie technique et sera en charge de : - Mise en place de pipelines automatises pour les simulations de dynamique moleculaire (MD) et l'integration de donnees experimentales. - Etude et analyse de la structure et de la dynamique des interactions entre LNPs et ARN par simulations de dynamique moleculaire (CG-MD) et methodes d'apprentissage automatique (ML).- Transfert des resultats obtenus sous forme de rapports structures, de scripts reproductibles et d'analyses a destination des collaborateurs academiques et industriels. - Determiner les parametres optimaux pour la prediction de l'efficacite d'administration de l'ARN en utilisant des approches integratives combinant MD et ML.
Profil recherché :
COMPETENCES ATTENDUES : Connaissances : -Simulation de dynamique moleculaire (MD) et modelisation computationnelle. -Bases de l'apprentissage automatique applique a la modelisation moleculaire. -Biophysique des nanoparticules lipidiques (un atout). -Bioinformatique appliquee aux systemes biomoleculaires. Savoir faire : -Developpement de pipelines d'automatisation pour les simulations. -Programmation (Python, Bash) et experience avec GROMACS ou equivalent -Traitement et analyse de grandes series de donnees issues de simulations. -Utilisation de logiciels d'analyse de trajectoires moleculaires. -Analyse de donnees, modelisation predictive et transmission des resultats. -(Autres) Utilisation de ressources de calcul intensif (HPC). Savoir etre : -Autonomie -Capacite d'organisation -Capacite a communiquer -Etre cooperatif Duree du contrat en mois : 12 mois Date d'embauche : Des que possible, au plus tard le 01/09/2025 Diplome souhaite : Master 2 en modelisation moleculaire, bioinformatique, chimie, biophysique computationnelle ou domaines proches. Experience souhaitee : Experience en stage ou en projet de recherche utilisant des simulations de dynamique moleculaire ou de la modelisation biomoleculaire. Remuneration indicative (visible par les candidats) : Selon la grille de l'ENS.
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