Bioinformaticienne / bioinformaticien

Mission

Le CHU de Dijon recrute un bioinformaticien pour les services de microbiologie-agents transmissibles et pathologie moléculaire. Vous mettrez au point des outils et solutions bioinformatiques permettant d’organiser, de comparer, d’analyser, et de diffuser des données biologiques.


Les différentes activités et périmètre du poste :

1. Analyse en génomique comparative, identification d’espèces
2. Assemblage, orfing et annotation de données issues de séquençage à haut-débit
3. Détection de variations constitutionnelles et somatiques à partir de données de séquençage à haut-débit
4. Développement des logiciels, scripts et interfaces nécessaires à l’exploitation des données biologiques et médicales
5. Développement de pipelines d’analyse, de méthodes d’automatisation des analyses
6. Paramétrage des outils, logiciels, systèmes relevant de son domaine d’activité
7. Mise en place de bases de données moléculaires
8. Conseil aux décideurs concernant les choix, les projets, les activités du domaine d’activité
9. Définition des prototypages et jeux d’essai
10. Définition et réalisation d’interfaces homme-machine
11. Identification de marqueurs génomiques de résistance aux antimicrobiens, de virulence ...
12. Développement des progiciels et programmation nécessaires à l’exploitation des données biologiques et médicales incluant le développement de Pipelines d'analyse bio-informatique des données issues du séquençage haut débit (NGS)
13. Savoir utiliser les outils, plateformes et pipelines d’analyses bioinformatiques déjà en place
14. Formation de personnes aux techniques et procédures de son domaine, et à leur application
15. Participation à la rédaction de publications scientifiques et médicales
16. Participation et présentation de travaux dans des congrès scientifiques
17. Recensement et analyse des besoins des utilisateurs, spécifiques à son domaine
18. Traitement et analyse de l’information/données médicale et/ou biologique : extraction, regroupement, représentation graphique
19. Veille scientifique et professionnelle
20. Prise en compte des enjeux de développement durable dans le cadre de l’application des missions
Pour plus d'informations sur le poste, merci de contacter : yannis.duffourd@u-bourgogne.fr

Profil

Vous avez un master en bioinformatique ou un diplôme d'école d'ingénieurs (INSA Lyon, ISBS...) ?

Vous avez une formation en biologie ou en biochimie ?

Vous disposez de connaissances approfondies en biologie moléculaire ?

Alors n'hésitez plus, postulez !

Les petits + :

21. Accès à l’ensemble du Plan de formation, très fourni (5 millions € par an dédiés à la formation)
22. Accès aux selfs du CHU, possibilité de demander des places de crèche du CHU
23. Accès au CGOS : vacances à prix réduit, tarifs préférentiels sur des spectacles, parc d’attractions, chèque culture, chèques vacances, etc.
24. Prise en charge de 75% de l’abonnement de transport en commun
25. Ateliers bien-être et salle de sport accessibles gratuitement