Mission :
Nous recrutons un ingénieur (H/F) en bioinformatique (ou biologie structurale computationnelle) pour travailler sur un projet à l'interface de la microbiologie, de la biologie structurale et de la bioinformatique. Ce projet concerne le complexe membranaire du système de sécrétion de type VI (T6SS), et vise à étudier son intégration dans l'enveloppe bactérienne ainsi que son impact sur la physiologie cellulaire.
La mission principale consistera à analyser et intégrer des données protéomiques (notamment issues de spectrométrie de masse top-down) et des prédictions structurales (AlphaFold) afin de caractériser les réseaux d'interactions protéiques impliqués dans l'assemblage et le fonctionnement du T6SS.
Activités :
- Exploitation de prédictions structurales (AlphaFold) pour caractériser les interactions protéine–protéine et les réseaux associés.
- Développement d'approches bioinformatiques pour la modélisation structurale, l'analyse de réseaux (PPIN) et le data mining à grande échelle.
- Analyses génomiques et évolutives pour explorer la conservation, la diversité et les co-évolutions des composants du T6SS et de leurs partenaires.
- Exploitation et intégration de données protéomiques (notamment AP-MS) pour identifier les partenaires d'interaction du T6SS.
- Collaboration étroite avec les équipes expérimentales pour interpréter les résultats et orienter les analyses.
- Développement de pipelines reproductibles et visualisation des résultats (figures, rapports scientifiques).
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