Développeur d'infrastructure cloud d'imagerie médicale

A propos du centre ou de la direction fonctionnelle

Le centre Inria de l'Université de Rennes est un des neuf centres d'Inria et compte plus d'une trentaine d'équipes de recherche. Le centre Inria est un acteur majeur et reconnu dans le domaine des sciences numériques. Il est au cœur d'un riche écosystème de R&D et d'innovation : PME fortement innovantes, grands groupes industriels, pôles de compétitivité, acteurs de la recherche et de l'enseignement supérieur, laboratoires d'excellence, institut de recherche technologique.

Contexte et atouts du poste

Dans le cadre d'un programme RHU (recherches hospitalo-universitaires, 5 ans) avec le CHU de Nantes : RHU eCAN.

Coordonné par le CHU de Nantes, le projet RHU eCAN vise à réduire l'impact des anévrismes intracrâniens en créant des outils pour radiologues, patients, experts et autorités réglementaires. L'objectif est de modifier la trajectoire des patients et d'améliorer l'efficacité médico-économique dans les systèmes de santé.

Le poste implique le développement sur une infrastructure cloud dédiée (Shanoir+VIP) pour le stockage et le traitement d'images médicales.

Shanoir (SHAring iN vivO Imaging Resources) est une plateforme web pour le partage d'images médicales in-vivo, utilisable pour tout type d'organes et pathologies, supportant diverses données d'acquisition et de traitement. Shanoir-NG est une application web cloud native développée avec Angular, Spring Boot 3 et Docker.

VIP est une plateforme web pour le traitement d'images, utilisée en collaboration avec l'équipe VIP (Creatis, CNRS, Lyon). Shanoir et VIP sont utilisés conjointement pour le stockage et le traitement d'images.

Mission confiée

En collaboration avec l'équipe de développeurs Shanoir, la personne recrutée opérera des traitements en masse et développera dans Shanoir.

Principales activités de développement logiciel :

* Comprendre la structure de Shanoir et son modèle de données
* Effectuer des traitements de masse sur les données dans Shanoir et VIP

Exécuter, surveiller et déboguer des scripts Python en utilisant l'interface REST de Shanoir et des scripts existants.

* Aider à l'intégration des images Docker dans VIP
* Développer l'intégration de pipelines de traitement
* Agréger les résultats en fonction des besoins scientifiques
* Travailler sur l'interopérabilité avec cleanWeb, eCRF
* Implémenter, tester et déployer en production

Notre serveur de production est accessible sur https://shanoir.irisa.fr.

* Déployer en production les extensions développées pour partager des données au-delà de FLI-IAM

Activités complémentaires :

* Tester, modifier et valider les nouvelles fonctionnalités
* Rédiger la documentation sur GitHub
* Participer à la roadmap de Shanoir
* Selon l'expérience

Gestion de projet

* Interaction avec les partenaires du programme RHU

Compétences requises :

* Formation supérieure en informatique (université ou grande école), spécialisée en développement logiciel
* 1 à 2 ans d'expérience en développement logiciel
* Bonne maîtrise de Java/Jakarta EE et Python pour le développement web
* Connaissance de Docker
* Bonnes compétences en anglais technique et scientifique, pratique orale

Connaissances en imagerie médicale et traitement d'images appréciées.

Avantages :

* Prise en charge partielle des frais de transport en commun
* Restauration subventionnée
* Prise en charge partielle de la mutuelle
* Possibilité de télétravail (jusqu'à 90 jours par an) et d'aménagement du temps de travail

Rémunération :

Brute mensuelle à partir de 2695 euros selon diplôme et expérience.

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