Ingénieur-e d'étude en cancérologie

Vos missions en quelques mots La personne recrutée participera à un projet de recherche translationnelle financé par l'INCa et intitulé " biomarqueurs prédictifs de la résistance au pembrolizumab néoadjuvant associé à la chimiothérapie dans les cancers du sein triple négatifs localisés". La mission principale consistera à analyser le microenvironnement immunitaire tumoral par imagerie de fluorescence multiplexe afin d’identifier des biomarqueurs prédictifs de résistance au traitement et/ou le risque de rechute. Activités principales : · Numériser des lames marquées par IF multiplexe (mIF 7-9 couleurs) à l’aide d’un scanner multispectral (PhenoImager, Akoya) · QC des images numériques et définition de stratégies d’analyses · Quantifier les images à l'aide du logiciel d'analyse d'images (HALO-AI, Indica Labs) : segmentation cellulaire et tissulaire, phénotypes · Consolider les données mIF avec R · Réaliser des analyses spatiales à l’aide de différentes méthodes computationnelles · Synthétiser et mettre en forme les données et les présenter lors de réunions de projet Profil recherché Connaissances · Connaissance des marquages IHC/IF multiplexes (anticorps et fluorochromes) · Notions de bases en histologie · Connaissances en immuno-oncologie · Connaissance en méthodes statistiques et computationnelles · Anglais scientifique (écrit et oral) Savoir-faire · Savoir utiliser en autonomie le scanner multispectral PhenoImager · Maitriser l’utilisation du logiciel d'analyse d'images Halo-AI · Savoir mettre en œuvre techniques d’analyse d’images et d’analyses spatiales · Savoir concevoir des bilans et présentations en anglais · Savoir utiliser les outils informatiques nécessaires aux missions confiées Aptitudes · Rigueur, assiduité, concentration · Organisation, autonomie et adaptabilité · Capacités de synthèse et de communication (écrit, oral) · Capacités d'écoute et de prise d’initiatives · Capacité à développer des compétences en analyses computationnelles · Capacité à travailler en équipe dans un cadre collaboratif • Master 2 ou équivalent Expérience de plus de 2 ans dans le domaine, avec expérience avérée en analyse d’images