Ingénieur(e) d'études en bioinformatique f/h

Mission principale:


La personne recrutée aura pour mission l’analyse et l’intégration bioinformatiques de données omiques (bulk RNAseq, single nuclei RNAseq, spatial transcriptomic, methylome) obtenus à partir d’échantillons tumoraux et de modèles tumoraux humains et murins. Elle travaillera en interaction avec l’investigateur principal, les bioinformaticiens senior et junior, les postdoctorantes, les ingénieures en biologie et les étudiant(e)s pour contribuer par son expertise bioinformatique aux projets de recherche de l’équipe.


Activités principales:


· Contrôle qualité, quantification de l’expression en bulk, cellule unique et transcriptomique spatiale, analyse de la variance, regroupement hiérarchique, analyse différentielle, annotation fonctionnelle, analyse récepteur-ligand

· Conception de signatures d’expression à partir de données en cellules uniques et appariemment avec les données transcriptomiques spatiales sans ou avec déconvolution

· Contrôle qualité et quantification de la méthylation ; conception de signatures de régions différentiellement méthylées, corrélation avec l’expression et analyse de l’hétérogénéité intratumorale et intertumorale



Autres informations:

- Temps de travail:
· Temps plein

· Nombre d’heures hebdomadaires : 38h30

· Congés Annuels et RTT : 32 jours + 12 jours : 44 jours


- Télétravail partiel possible ouvert à discussion

- Bureau partagé

- Travail en majorité en présentiel

- Rémunération :
· A partir de 2 494,30 € € bruts mensuels, à réévaluer en fonction de l'expérience professionnelle sur des fonctions de niveau équivalent


- Connaissances:


· Bases de la biologie moléculaire, niveau premier cycle

· Formation de second cycle en bioinformatique

· Structures de données et Algorithmes en Transcriptomiqu

· Clustering et Réduction de dimension

· Machine learning


- Savoir-faire:


· Langage de programmation : Python, R

· Réalisation d’un projet de programmation en interaction avec les utilisateurs et avec adaptation du projet aux besoins et retours des utilisateurs

· Présentation et communication de l’avancée d’un projet


- Aptitudes:


· Autonomie, organisation du temps de travail

· Travail en équipe avec les bioinformaticiens et non bioinformaticiens

· Curiosité avec recherche critique de ressources bibliograpiques et méthodologiques


L’Inserm est le seul organisme public français entièrement dédié à la recherche biologique, médicale et en santé des populations. Il dispose de laboratoires de recherche sur l’ensemble du territoire, regroupés en 12 Délégations Régionales. Notre institut réunit 15 000 chercheurs, ingénieurs, techniciens et personnels administratifs, avec un objectif commun : améliorer la santé de tous par le progrès des connaissances sur le vivant et sur les maladies, l’innovation dans les traitements et la recherche en santé publique.

Rejoindre l’Inserm, c’est intégrer un institut engagé pour la parité et l’égalité professionnelle, la diversité et l’accompagnement de ses agents en situation de handicap, dès le recrutement et tout au long de la carrière. Afin de préserver le bien-être au travail, l’Inserm mène une politique active en matière de conditions de travail, reposant notamment sur un juste équilibre entre vie personnelle et vie professionnelle.

L'Inserm a reçu en 2016 le label européen HR Excellence in Research et s'est engagé à faire évoluer ses pratiques de recrutement et d'évaluation des chercheurs.

Institut du Cerveau (ICM) – U1127:

L’Institut du Cerveau est une Fondation privée reconnue d’utilité publique dont l’objet est la recherche fondamentale et clinique sur le système nerveux. Sur un même lieu, 850 chercheurs, ingénieurs et médecins couvrent l’ensemble des disciplines de la neurologie, dans le but d’accélérer les découvertes sur le fonctionnement du cerveau et les développements de traitements sur les maladies comme : Alzheimer, Parkinson, Sclérose en plaques, épilepsie, dépression, paraplégies, tétraplégies, etc.

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