Bio-informaticien - h/f

Description du poste


Dans un contexte de renforcement de notre activité de séquençage à haut débit (production et développement), nous recherchons, en CDI, un(e) :

Bio-informaticien – H/F

L’équipe de bio-informatique, constituée de 3 bio-informaticiens + 1 technicien bio-informatique, a pour but de mettre en place les pipelines d’analyse de données (notamment de séquençage), afin de permettre leur interprétation par les biologistes et scientifiques s’intéressant à différentes thématiques médicales : génétique constitutionnelle, oncologie, infectiologie…

Vos missions seront les suivantes :

* Veiller au bon déroulement des pipelines d’analyses de production
* Participer à la résolution des problèmes et répondre aux interrogations des biologistes et scientifiques
* Développement de nouveaux pipelines d’analyses de données, intégration à l’environnement de production, qualification selon la norme ISO15189 et montée en version
* Evaluer les outils bio-informatiques existants et apporter des nouvelles solutions pour l’analyse de données diverses (ADN, ARN, short reads, long reads …), en réponse à différence questions médicales.
* Participer à la cartographie et à l’optimisation des processus bio informatiques




Qualifications


Vous avez validé un Master en bio-informatique ou équivalent, vous disposez de connaissance en génétique humaine et en analyse de données de séquençage haut-débit.

La maitrise de différents langages de programmation (R, Python) et d’un interprétateur de commandes (Bash/Shell) est indispensable. La maitrise du gestionnaire de workflow Nextflow, ainsi que d’outils de visualisation sera appréciée. Les formats courants lors de l’analyse de données de séquençage (fastq, vcf, bam …) vous sont familiers.

Des connaissances avancées en statistiques et intelligence artificielle seront appréciées, ainsi qu’une expérience passée en laboratoire de diagnostic médical.

Votre capacité d’adaptation, votre curiosité et votre bienveillance vous permettront de travailler en collaboration avec les biologistes et scientifiques des équipes de génétique constitutionnel, oncologie et infectiologie.

Enfin, la connaissance de l’anglais écrit et oral est indispensable pour être en réussite sur ce poste.

Nous cherchons une personne enthousiasmée par la perspective de déployer des outils innovants dans le cadre du diagnostic de précision !

Eurofins Biomnis est engagé dans une politique en faveur de l'insertion des travailleurs handicapés. Une adaptation au poste selon les profils sera toujours étudiée.



Informations supplémentaires


Poste à temps plein

Plage horaire : du lundi au vendredi

Localisation : Lyon 7ème

Prise de poste : dès que possible

Statut : cadre



Rémunération et avantages :

Salaire annuel brut selon expérience

Restaurant d’entreprise

RTT

Accord de participation et d’intéressement

Accord relatif au télétravail

Prime de cooptation

Diverses actions QVT (participation à des évènements sportifs et caritatifs, etc.)



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