En tant qu'organismes sessiles, les plantes sont exposées à divers stress environnementaux nécessitant des réponses physiologiques, cellulaires et nucléaires. L'un de ces facteurs de stress est constitué des composantes ultraviolettes de la lumière solaire, spécifiquement les UV-A et UV-B, qui posent des défis pour de nombreux organismes. Ces rayons UV peuvent pénétrer les tissus eucaryotes et affecter directement l'intégrité du génome en causant des lésions de l'ADN.
Au sein d'un consortium plus large étudiant divers aspects de la réponse nucléaire à l'irradiation UV, l'objectif de ce projet est d'étudier comment le repliement 3D de la chromatine est affecté par le stress induit par les UV et comment il y répond. Nous nous intéressons non seulement à la manière dont l'irradiation UV peut altérer les motifs de repliement 3D dans les noyaux d'Arabidopsis thaliana, mais aussi à la question de savoir si certaines caractéristiques du repliement 3D de la chromatine peuvent atténuer les effets nocifs de l'irradiation UV.
Activités
Pour ce projet de recherche, nous utiliserons une large gamme d'outils en génomique, biologie moléculaire et bio-informatique. Le projet inclura la réalisation de plusieurs expériences Hi-C sous différents régimes lumineux, stades de développement et contextes génétiques. Compte tenu de la grande quantité de données collectées, un second accent de ce projet sera mis sur la formation de l'ingénieur de recherche (H/F) aux outils bio-informatiques et leur exécution ultérieure. Cela permettra l'analyse des données Hi-C et leur intégration avec d'autres ensembles de données épigénomiques obtenus par le consortium. En parallèle, la personne retenue est invitée à s'engager dans un projet secondaire aligné sur les axes de recherche de l'équipe.
Compétences
Les compétences requises comprennent :
Connaissance approfondie de la biologie moléculaire et bonne compréhension de la biologie/épigénétique de la chromatine végétale.
Une expérience antérieure en analyse et en codage de données bio-informatiques serait un plus.
Excellente connaissance de l'anglais, écrit et parlé (niveaux B2).
Être prête à s'engager pleinement dans un projet. Une participation intellectuelle critique ainsi que la volonté de mener des expérimentations manuelles exigeantes sont attendues.
Contexte de travail
Le candidat (H/F) rejoindra l'unité de recherche sur l'organisation du génome 3D dirigée par Stefan Grob à l'Institut de Biologie Moléculaire des Plantes (IBMP) à Strasbourg. L'IBMP accueille d'excellentes équipes de recherche, met à disposition un large éventail de plateformes de pointe pour soutenir ce projet et offre un environnement convivial et stimulant.
Au sein de notre équipe, nous nous efforçons de proposer une atmosphère de travail inclusive et motivante, dans laquelle les initiatives ainsi que les contributions intellectuelles et techniques sont particulièrement valorisées.
L'IBMP bénéficie d'un emplacement privilégié à Strasbourg, sur le campus de l'Esplanade, avec de nombreuses infrastructures sur place (cafétéria, installations sportives, etc.) et un accès facile en transports en commun.
Le candidat (H/F) pourra être amené à travailler à des horaires irréguliers en fonction des besoins du projet.
Le candidat (H/F) rejoindra l'unité de recherche sur l'organisation du génome 3D dirigée par Stefan Grob à l'Institut de Biologie Moléculaire des Plantes (IBMP) à Strasbourg. L'IBMP accueille d'excellentes équipes de recherche, met à disposition un large éventail de plateformes de pointe pour soutenir ce projet et offre un environnement convivial et stimulant.
Au sein de notre équipe, nous nous efforçons de proposer une atmosphère de travail inclusive et motivante, dans laquelle les initiatives ainsi que les contributions intellectuelles et techniques sont particulièrement valorisées.
L'IBMP bénéficie d'un emplacement privilégié à Strasbourg, sur le campus de l'Esplanade, avec de nombreuses infrastructures sur place (cafétéria, installations sportives, etc.) et un accès facile en transports en commun.
Le candidat (H/F) pourra être amené à travailler à des horaires irréguliers en fonction des besoins du projet.
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