L'équipe étudie la régulation des Eléments Transposables (séquences répétées d'ADN potentiellement mobiles et/ou régulatrices) et des éléments mobiles chez la plante modèle Arabidopsis : les bases moléculaires de leur activation en réponse à des stress biotiques et les mécanismes épigénétiques qui peuvent les contrôler négativement.
La mission consiste à disséquer la régulation d'éléments transposables et éléments mobiles (T-DNA) durant l'interaction Arabidopsis-Agrobacterium en mettant en oeuvre différentes méthodologies en lien avec l'analyse de la chromatine, de l'ARN et des protéines afin de finaliser une étude en cours. De plus, la mission consiste aussi à servir de soutien ad hoc à différents projets du laboratoire.
Activités
- Activité 1 : Mise en oeuvre de méthodologies pour l'étude de la régulation d'éléments transposable durant l'interaction Arabidopsis-Agrobacterium : Culture de plantes in vitro - infection par Agrobacterium - coloration GUS - western blot - extraction d'ARN et RT-qPCR - clonage - exploration et visualisation de données de séquençage ONT long-read disponibles sur Integrative Genome Browser (IGV)"
Activité 2 : Apporter un soutien technique ad hoc aux projets de recherche développés dans l'équipe : génotypage -obtention et collecte du matériel biologique quand nécessaire- aide à immunoprécipitation de la chromatine
Activité 3 : Interagir avec les services de soutien et support (magasin, serres) de l'I2BC-participation aux commandes, au maintien de la base de données, à la gestion des stocks
Activité 4 : Présentation et communication des résultats en réunion d'équipe et séminaire de département
Compétences
° avoir un diplôme de MSc/Master en biologie - biologie moléculaire ou sciences végétales
curiosité et rigueur scientifique
intérêt pour les interactions plante-pathogène et l'épigénétique des plantes ,et forte motivation
° connaissances théoriques et pratiques solides en biologie moléculaire et en interactions plante-pathogène
avoir une attitude active dans la résolution de problèmes et un goût pour le challenge
avoir de bonnes compétences en communication et être capable de travailler au sein d'une équipe internationale et de collaborer avec d'autres chercheurs et étudiants \_ une expérience préalable avec des modèles d'Arabidopsis ou d'Agrobacterium est un avantage
avoir une bonne connaissance de l'anglais à l'oral et à l'écrit : niveau B2 (cadre européen commun de référence pour les langues)
Contexte de travail
Le poste est à pourvoir dans l'équipe ERTEA qui mène des études sur la régulation épigénétique des éléments transposables chez la plante modèle Arabidopsis thaliana. Il s'agit d'une équipe dynamique essentiellement constituée d'étudiants en M1 et M2 (généralement 1 à 2 par an), doctorants ou chercheurs contractuels (généralement 1 à 3) et une ingénieure d'étude CNRS, avec un fort esprit collaboratif et de discussion au sein de ses membres. L'équipe possède de nombreuses collaborations en France et à l'étranger et fait partie de deux réseaux CNRS nationaux « Epiplant » et « Mobile DNA ». L'équipe est située dans un tout nouveau bâtiment de l'Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC) au sein du département de Biologie des Génomes.
Contrat de 6 mois pour finaliser une étude (extension de 1 mois possible en fonction des besoins).
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