Nous recherchons un postdoctorant (H/F) en modélisation de la géomicrobiologie (poste de niveau doctorat) à Marseille, en France, pour travailler sur le projet financé par la European Research Council Starting Grant « SIESTA : The Role of Microbial Dormancy as an Ecological and Biogeochemical Regulator on Earth ». Le poste est sous la supervision du Dr James Bradley (https://www.jbradleylab.com/). La personne recrutée travaillera avec ce chef de projet et participera aux travaux de modélisation théorique et numérique, au sein d'une équipe comprenant des doctorants et du personnel technique. L'objectif principal de ce contrat postdoctoral est (1) de développer des approches de modélisation théorique (bioénergétique, thermodynamique, modélisation écologique, individual-based modelling, modélisation biogéochimique) pour étudier l'activité et la dormance des communautés microbiennes dans des environnements extrêmes (y compris la cryosphère), et (2) de relier l'activité et la dormance de ces communautés aux processus écologiques et biogéochimiques. Ce travail s'inscrira dans les objectifs plus larges du projet visant à comprendre le rôle de la dormance comme régulateur des cycles biogéochimiques et à établir un lien entre la dormance et l'émergence, la survie et l'évolution des populations microbiennes.
Les candidats doivent être titulaires d'un doctorat dans une discipline pertinente des sciences naturelles, posséder des connaissances spécialisées et une expérience avérée en modélisation numérique, bioénergétique, écosystémique et/ou d'habitabilité, de solides compétences mathématiques et une expérience en programmation, ainsi qu'une expérience en analyse de données observationnelles et/ou dérivées de modèles. Le CDD est proposé pour une durée de deux ans, renouvelable annuellement, sous réserve d'évaluations de performance satisfaisantes. La date de début est flexible, à partir de février 2026 environ, et peut être ajustée en fonction des disponibilités du candidat et des exigences du projet.
Les candidats doivent soumettre EN ANGLAIS : 1) un curriculum vitae à jour ; 2) une lettre de motivation (maximum 2 pages) précisant leur motivation, leurs intérêts de recherche, leurs compétences, leur formation et leur expérience ; 3) les coordonnées d'au moins deux et jusqu'à trois références professionnelles. Veuillez regrouper ces documents dans un seul PDF. Important : Veuillez également envoyer un courriel au Dr James Bradley (@.**) pour confirmer votre candidature. Postulez dès que possible. La période de candidature sera ouverte pendant trois semaines après la publication de l'annonce en ligne, puis de manière continue (selon la sélection ou non du candidat). Pour toute question, veuillez contacter le Dr James Bradley (@.**).
Activités
Le postdoctorant (H/F) contribuera à différents aspects de recherche du projet :
- Développer, mettre en oeuvre et appliquer des outils de modélisation écologique (bioénergétique, thermodynamique, modélisation écologique, individual-based modelling, modélisation biogéochimique) pour étudier l'activité et la dormance des micro-organismes.
- Déterminer les paramètres énergétiques et environnementaux limitant l'activité, la dormance et la survie des communautés microbiennes.
- Déterminer et évaluer l'activité catabolique et anabolique, ainsi que les taux plausibles de réactions génératrices et consommatrices d'énergie pour les micro-organismes actifs et dormants.
- Relier les caractéristiques physicochimiques d'un environnement (et ses changements) à l'activité (et à la dormance) de la population microbienne qui y réside.
- Évaluer dans quelle mesure l'activité et la dormance des micro-organismes (et les transitions entre les états actif et dormant) régulent les processus écologiques (biomasse, diversité, fonction) et la biogéochimie (composition géochimique et flux élémentaires).
- Publier (en tant qu'auteur principal et co-auteur) dans des revues universitaires, participer à des conférences scientifiques et à des activités de sensibilisation pour la science.
- Rassembler et cataloguer les données en vue de leur dépôt et de leur archivage dans des référentiels de données.
Compétences
- Doctorat (au moment de la nomination) dans une discipline pertinente des sciences naturelles et expérience avérée en recherche, incluant des publications évaluées par des pairs.
- Connaissances spécialisées et expérience démontrable en modélisation numérique, bioénergétique, écosystémique et/ou d'habitabilité.
- Solides compétences en mathématiques et expérience en programmation.
- Expérience de l'analyse d'ensembles de données d'observation et/ou de modélisation.
- Excellente compréhension des processus microbiens dans le contexte de l'écologie microbienne, de l'habitabilité, de l'astrobiologie et/ou des environnements extrêmes.
- Écriture et exécution de code en R, Python, GitHub, etc., et calcul haute performance.
- Preuve de capacité à publier des résultats de recherche dans des revues internationales à comité de lecture.
- Capacité à organiser et à prioriser son propre travail, et à organiser la recherche dans le respect du calendrier du projet.
- Excellentes compétences en communication orale et écrite en anglais.
- Capacité à travailler de manière autonome et flexible.
- Capacité à travailler en équipe.
Contexte de travail
Le candidat retenu (H/F) travaillera à l'Institut Méditerranéen d'Océanologie (MIO), à Marseille Luminy. Le MIO est un laboratoire de recherche en océanographie des universités d'Aix-Marseille, de Toulon, du CNRS et de l'IRD. Il est intégré à l'OSU Pythéas. Ses objectifs sont de mieux comprendre le système océanique et son évolution face aux changements globaux. Il constitue un pôle d'expertise en biologie, écologie, biodiversité, microbiologie, halieutique, physique, chimie, biogéochimie et sédimentologie marine. Ses cadres de recherche sont l'océan mondial, ses interfaces avec le continent, l'atmosphère et les sédiments. Le MIO compte plus de 250 personnes, dont une centaine de chercheurs (CNRS, IRD) et d'enseignants-chercheurs universitaires, une soixantaine d'ingénieurs et techniciens, plus de 50 doctorants et une équipe administrative au service de la recherche. Le candidat (H/F) rejoindra l'équipe du MEB et travaillera au sein du projet ERC SIESTA dirigé par James Bradley. Le candidat retenu (H/F) bénéficiera d'un groupe de recherche dynamique, d'un accès aux excellentes installations et plateformes de recherche de l'Institut Méditerranéen d'Océanographie et d'Aix-Marseille Université, et sera intégré à une équipe engagée en faveur d'une intégrité scientifique élevée, d'une science ouverte et reproductible, et de la promotion de l'inclusion. Marseille est une ville abordable, dynamique et historique située sur la côte méditerranéenne, offrant une excellence culinaire, des expériences culturelles diversifiées et une importante communauté internationale. L'Institut Méditerranéen d'Océanographie, situé sur le campus de Luminy d'Aix-Marseille Université, est entouré de nature et niché au coeur du spectaculaire parc national des Calanques.
Contraintes et risques Le travail impliquera des déplacements pour participer à des réunions scientifiques afin de diffuser les résultats. Il pourra également (selon les besoins du projet et l'intérêt du candidat) impliquer des déplacements et des travaux de terrain dans des environnements reculés (glaciaires, arctiques) pour la collecte d'échantillons.
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