Ingénieur en bioinformatique

Environnement de travail

Vous serez basé.e au CIRB au sein du Collège de France et au LCQB sur le campus de Jussieu de Sorbonne Université, ainsi qu’à l’IBENS au sein de l’ENS.

Vos interlocuteurs principaux seront les Dr Samuel Alizon (CIRB), Anna Zhukova (IBENS) et Laurent Jacob (LCQB).













Missions

Vous serez placé.e sous l'autorité hiérarchique du Dr Samuel Alizon.



Vos principales missions seront les suivantes :

- Exploiter et modifier des modèles d’apprentissage profond existant

- Analyser des jeux de données existants

- Réaliser des programmes de simulation de données

- Réaliser des rapports sur les travaux effectués

- Assurer une veille bibliographique





Activités principales

- Conception de programme pour réalisation de simulation d’épidémies et génération de données de séquence génétique

- Utilisation d’algorithmes d’apprentissage profond existants pour analyser les données simulées

- Ajustement d’algorithmes d’apprentissage profond existants pour prendre en charge de nouvelles données

- Modification d’algorithmes d’apprentissage profond existants pour gérer des nouveaux scenarios biologiques

- Analyse statistique des données simulées

- Rédaction de rapports scientifiques en anglais

- Veille bibliographique





Compétences

- Excellentes connaissances en modélisation mathématique en biologie

- Excellentes connaissances en programmation sur au moins un langage de haut niveau et un langage de bas niveau

- Excellentes connaissances en statistiques

- Bonnes connaissances théoriques en apprentissage profond

- Bonnes connaissances en épidémiologie et/ou en biologie de l’évolution

- Bonne maîtrise de l'anglais (écrit, lu, parlé)





Particularités du poste

Le poste implique un travail sur deux sites