Postdoctorat en deep learning et modèles de langage sur adn pour la bioinformatique (h/f)

Informations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR5535-SARADE-104 Date de début de diffusion 27/02/2026 Date de parution 28/02/2026 Date de fin de diffusion 20/03/2026 Intitulé long de l'offre Postdoctorat en deep learning et modèles de langage sur ADN pour la bioinformatique (H/F) Date limite de candidature 20/03/2026 Nature du contrat CDD d'1 an Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Chercheuse / Chercheur Statut du poste Vacant Intitulé du poste Postdoctorat en deep learning et modèles de langage sur ADN pour la bioinformatique (H/F) Descriptif de l'employeur Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique. Description du poste Missions : Ce projet développe un nouveau paradigme de modèles d’Interprétation Générale du Génome (GenGI) en combinant des modèles de langage ADN (DLLMs) avec des réseaux de neurones profonds afin de prédire des phénotypes humains directement à partir de données de séquençage d’exome complet issues de la UK Biobank. L’objectif est la prédiction à large spectre de phénotypes humains, ouvrant de nouvelles perspectives en génétique clinique, médecine de précision, prédiction du risque de maladie et IA explicable appliquée aux données génomiques. Activités : La personne devra : – Se familiariser avec les recherches et méthodes existantes en interprétation du génome – Se familiariser avec les données de séquençage et leur prétraitement – Étudier le fonctionnement des modèles de langage ADN et développer des solutions pour les intégrer aux architectures de réseaux de neurones du laboratoire – Développer des solutions pour améliorer la scalabilité des réseaux de neurones et des grands modèles de langage aux données de séquençage du génome entier – Développer des algorithmes et architectures pour la prédiction de sorties structurées (arbres, graphes) – Mettre en œuvre des méthodes d’interprétation des prédictions des réseaux de neurones, incluant des activations basées sur des concepts et des analyses contrefactuelles Contexte de travail : La candidate ou le candidat rejoindra la nouvelle équipe de recherche en IA dirigée par Daniele Raimondi au sein de l’Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM, UMR5535 CNRS/Université de Montpellier) pour une durée de 12 mois, renouvelable sous certaines conditions pour jusqu’à 36 mois supplémentaires si les résultats permettent d’obtenir des financements complémentaires. Le poste est basé à l’IGMM (www.igmm.cnrs.fr), dans un environnement de recherche hautement international et interdisciplinaire. Montpellier est une ville méditerranéenne dynamique, offrant un cadre de vie agréable, une riche culture et un environnement scientifique exceptionnel. La ville accueille de nombreux instituts de recherche de haut niveau ainsi que l’Université de Montpellier, forte de 70 000 étudiants et abritant l’une des plus anciennes facultés de médecine au monde. L’institut rassemble plus de 200 personnes (chercheurs, ingénieurs, techniciens et étudiants), organisées en 18 équipes de recherche, et bénéficie de services communs mutualisés, ainsi que de plateformes technologiques et scientifiques performantes. L'agent travaillera au sein du groupe AI4GI, dirigé par le Dr Daniele Raimondi. Le groupe développe des méthodes avancées d’intelligence artificielle et d’apprentissage automatique pour l’interprétation du génome, avec un accent particulier sur la modélisation des relations entre variation génétique et phénotypes. AI4GI développe des architectures de réseaux de neurones sur mesure, incluant des modèles parcimonieux et biologiquement informés, afin de prédir Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr Conditions particulières d'exercice Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche. Descriptif du profil recherché Competences : Nous recherchons une personne motivée et curieuse, avec une solide expérience dans le développement de méthodes d’apprentissage automatique pour la bioinformatique. Le projet porte sur le développement de nouvelles architectures de réseaux de neurones pour l’inférence à partir de données de séquençage. La personne devra être désireuse d’apprendre continuellement de nouvelles compétences, méthodes et concepts, et apprécier la recherche de solutions face à des difficultés nouvelles et imprévues. Compétences techniques : - Programmation Python avancée et expérience en calcul scientifique (PyTorch, scikit-learn, NumPy, etc.) - Réseaux de neurones et apprentissage automatique : solide compréhension des concepts et des fondements mathématiques, y compris l’algèbre linéaire (opérations vectorielles et matricielles) et l’optimisation - Familiarité avec GNU/Linux et les environnements de développement associés - Compétences en traitement de données génomiques (séquençage d’exome ou de génome complet) et pipelines de bioinformatique sont un plus - Connaissances en GWAS, génétique des populations ou concepts de base en génétique et biologie sont appréciées mais non obligatoires Compétences générales : -Capacité de résolution de problèmes complexes - Bonnes compétences en communication et aptitude au travail en équipe - Niveau d’anglais minimum B2 requis Contraintes et risques : Temps plein Oui Rémunération contractuels (en € brut/an) A partir de 3071€ brut ajustable selon expérience Localisation du poste Europe, France, Occitanie, Hérault (34) Géolocalisation du poste MONTPELLIER Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 34293 MONTPELLIER (France) Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents Spécialisation Formations générales Langues Français (Seuil)