Poste : Au sein de la Direction des Services Opérationnels et Innovants, le service bio-informatique a pour principales missions de traiter les données de génomique, participer à la mise à disposition doutils bio-informatiques et apporter son expertise bio-informatique à lensemble des collaborateurs du CAD et aux porteurs de projets externes, nationaux ou internationaux. Les données concernées sont les données de génomique mises à disposition auprès du CAD (BAM / CRAM VCF, données contextuelles) issues de séquençages (principalement WES et WGS). Le traitement intervient sur lensemble du cycle de vie de la donnée, depuis lévaluation de la qualité des données réceptionnées jusquà la réalisation de projets en lien avec celles-ci.
En tant que Responsable de Service Bio-Informatique, vos missions principales sont :
* Manager le service bio-informatique composé de 3 bio-informaticiens
* Sassurer du bon usage (pertinence des choix logiciels et algorithmiques) et des paramétrages logiciels pour une bonne exécution des logiciels bio-informatiques
* Configurer et optimiser les "pipelines bio-informatiques" pour exploiter au mieux linfrastructure proposée par le CAD
* Apporter expertise et conseil aux porteurs de projets scientifiques
* Proposer des approches et méthodologies bio-informatiques pour répondre aux problématiques scientifiques des projets
* Contribuer au développement de nouvelles approches bio-informatiques (design, prototypage et documentation)
* Assurer la gestion du catalogue de logiciels bio-informatiques
* Participer à lidentification et à lévaluation des solutions danalyse des données génomiques et cliniques répondant aux besoins du CAD, tant en support des projets internes quexternes
Profil : Issu dune formation supérieure spécialisée en bio-informatique, vous évoluez depuis plus de 5 ans dans lingénierie de logiciels bio-informatiques. Vous êtes un expert de la manipulation de données "omiques" et des approches bio-informatiques. Vous maîtrisez les moteurs de workflow tels que Snakemake ou Nextflow et le cadre réglementaire appliqué à lutilisation de données de santé et au développement de logiciels de santé.
Reconnu pour votre esprit danalyse et votre sens de linnovation, vous conjuguez expertise métier et capacité à fédérer une équipe. Vous accompagnez vos collaborateurs avec bienveillance et exigence dans une logique de recherche de performance et dinnovation. Vous démontrez de réelles aptitudes à la prise de décision et au développement dune logique partenariale avec des acteurs variés de lécosystème de la Santé.
Entreprise : Hadley Search, cabinet de recrutement dédié aux acteurs du secteur public et aux collectivités, recrute pour le Collecteur Analyseur de Données (CAD), un Responsable de Service Bio-Informatique F / H.
Le CAD est un Groupement dIntérêt Public développé dans le cadre du Plan France Médecine Génomique 2025 (PFMG). Créé le 30 novembre 2022, le GIP-CAD regroupe les représentants de lÉtat (MSP et MESR), les Laboratoires de Médecine Génomique SeqOIA et AUTRAGEN, Unicancer, la Conférence des Directeurs Généraux de CHU, le CEA, lInria, lInserm et France Universités.
Le GIP-CAD a pour but de proposer des services liés à lactivité de soin du PFMG : aide à linterprétation médicale des examens pangénomiques effectués par les Laboratoires de Médecine Génomique du PFMG, aide à la réanalyse des données et archivage des données de séquençage. Il a également pour objectif de permettre la réutilisation des données de génomique pour la recherche.
Le Plan France Médecine Génomique 2025, initié en 2016, développe les conditions nécessaires à laccès à tous au diagnostic génétique en France. Il vise 3 objectifs : intégrer la médecine génomique dans le parcours de soins courant et la prise en charge des pathologies, développer une filière nationale de médecine génomique au service des patients capable dêtre un levier dinnovation scientifique et technologique, et placer la France dans le peloton de tête des grands pays engagés dans la médecine personnalisée.
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