Ingénieur / ingénieure de recherche scientifique (h/f)

Mission :
Dans le cadre du project ScalingRules (ANR Chaird'Excellence France 2030), le laboratoire du Dr Basto recrute un/une IE en analyse dI'image a temps plein pour contribuer aux recherches du labo qui vise a comprendre comment les cellules polyploides regulent leur taille optimalle en assurant leur function. Cela, s'inscrit dans le projet globale du laboratoire visant a etudier les transitions de ploidie, cycle cellulaire et mantiens de stabilite genetique. Ce poste est idéal pour une personne ayant une formation en analyse quantitative d'images et une expérience de l'utilisation de Python, à la fois avec des techniques classiques de traitement d'images (seuillage, filtres, etc.) et des frameworks d'apprentissage profond.

Activités :
-Analyser des images biomédicales issues de différentes plateformes de microscopie (par exemple : confocale, light-sheet, fluorescence, microscopie électronique).
- Développer et appliquer des pipelines de traitement d'images en Python (par exemple à l'aide de bibliothèques telles que NumPy, SciPy, OpenCV, scikit-image et TensorFlow/PyTorch).
- Automatiser les tâches de segmentation, de quantification et de classification à l'aide de techniques d'apprentissage automatique et d'apprentissage profond.
- Collaborer avec des biologistes et des cliniciens afin d'interpréter les données d'imagerie et de soutenir des recherches guidées par des hypothèses.
- Maintenir des flux de travail d'analyse reproductibles à l'aide de systèmes de contrôle de version (par exemple Git) et de notebooks Jupyter.
- Aider à la préparation des données pour les publications et les présentations.