Ingénieur biologiste en analyse de données (h/f)

Vos missions en quelques mots Missions : L'agent rejoindra le groupe 'Dynamique Chromatinienne et Hématopoïèse' dirigé par Eric Soler à l'IGMM. L’ingénieure ou l’ingénieur de recherche aura pour mission : - Conception, développement et optimisation de pipelines bioinformatiques pour l'analyse de données de séquençage à haut débit, incluant les données sur cellules uniques (transcriptome et épigénome), et les données issues de séquençage 'long-reads' ; - Analyser les besoins spécifiques en matière de bioinformatique et data science, et fournir des solutions adaptées ; -Harmoniser les process de traitement de données multi-omiques ; - Déployer des outils avancés de Machine Learning, Deep Learning et data science pour extraire des informations pertinentes des données génomiques. Activités : - Appliquer les techniques de Machine Learning, Deep Learning et Data Science pour l’analyse de données de séquençage à haut débit (NGS). - Développer et gérer la maintenance de logiciels, d'outils bioinformatiques et de modèles de Data Science. - Analyses multi-omiques, intégration de données short-reads/long-reads - Former et superviser les chercheurs sur les techniques avancées de bioinformatique et Data Science. - Assurer une veille technologique pour rester à jour avec les dernières avancées en bioinformatique, Data Science, Machine Learning et Deep Learning. Contexte de travail : L'Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier est une unité mixte de recherche CNRS et Université de Montpellier, de 200 personnes réparties en 18 groupes de recherche, 9 services communs (dont 5 mutualisés avec d'autres unité du campus CNRS) et 9 plateformes technologiques et scientifiques. L'IGMM est un institut multidisciplinaire dont les travaux ont un impact international fondamental et appliqué en biologie moléculaire et cellulaire (www.igmm.cnrs.fr). L’ingénieure ou l’ingénieur de recherche sera affecté dans l'équipe « Dynamique chromatinienne et hématopoïèse » (10 membres) dirigée par le Dr. Eric SOLER à l'IGMM. Le travail d'équipe s'effectue dans le contexte d'interactions avec des équipes cliniques et fondamentales, mais aussi de biologie computationnelle, dans un environnement pluridisciplinaire. Outre son environnement enrichissant, le CNRS offre les avantages suivants : - cycle hebdomadaire de travail de 38h30 - 44 jours de congés et RTT avec possibilité d'acquérir 2 jours pour fractionnement, soit 46 jours au maximum/an - possibilité de bénéficier du forfait mobilités durables - complémentaire santé, sous conditions - restaurant collectif sur place à un tarif avantageux - parking - offres loisirs sports et culture via le comité d'action et d'entraide sociale (CAES du CNRS) ou les comités locaux d'action sociale (CLAS) Profil recherché Competences : - Doctorat en biologie, - Master ou équivalent en biologie computationnelle ou bioinformatique - Maîtrise des langages de programmation tels que Python, R, Java et Bash. - Expérience approfondie avec les frameworks de Machine Learning et de Deep Learning tels que TensorFlow et PyTorch. - Connaissance des méthodes et outils de Data Science pour l'analyse et la visualisation de données complexes. - Capacité à travailler en équipe et à communiquer efficacement avec des chercheurs de diverses disciplines. - Compétences en gestion de projet. Contraintes et risques : Niveau d'études minimum requis Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie) Langues Français Seuil