Chercheur post-doctorant h/f - shine vertyca

RESPONSABILITÉS :

Ref Emploi : CARRTELVERTYCA
Affectation : CARRTEL (composante d'affectation : UFR SceM) - Thonon les Bains
I. Description du projet et activités de recherche associées
Les efflorescences algales et cyanobactériennes représentent une menace croissante pour les écosystèmes lacustres et la santé humaine. Ces blooms peuvent perturber gravement les usages des lacs. Si leur dynamique est globalement connue, leur détection reste parfois difficile, notamment pour les espèces se développant en profondeur, comme Planktothrix rubescens. Le changement climatique et les pressions anthropiques renforcent ces phénomènes, y compris dans des lacs peu nutritifs.
Ce projet propose une approche novatrice combinant écologie lacustre et modélisation mathématique pour mieux comprendre, anticiper et prévenir ces efflorescences. Il réunit les expertises du laboratoire CARRTEL et du LAMA, dans le cadre des axes scientifiques de l'USMB, centrés sur les interactions homme-environnement.
L'objectif final est de construire un modèle unidimensionnel vertical (1DV) mécaniste décrivant la niche écologique de phytoplancton selon leurs stratégies (C, S, R). Ce modèle intégrera les dynamiques de compétition pour la lumière et les nutriments, l'influence des niveaux trophiques, du parasitisme et de l'allélopathie. Il s'appuiera sur des modèles existants (chemostat, AED, BLOOM) pour tester divers scénarios environnementaux (température, nutriments, lumière, circulation) et identifier des seuils critiques favorisant ou non les blooms.
II. Missions et activités du poste
Les principales missions sont :
(i) reproduire la distribution verticale du phytoplancton via la modélisation,
(ii) mieux comprendre les facteurs écologiques des proliférations,
(iii) fournir un outil d'aide à la décision pour les gestionnaires de lacs.
Les hypothèses clés reposent sur l'importance des interactions biologiques et des variations environnementales (climat, activité humaine) dans la structuration du phytoplancton.
La personne recrutée devra :
• développer un modèle mathématique intégrant les mécanismes essentiels influençant le positionnement des pics phytoplanctoniques ;
• implémenter ce modèle (en Python), en interaction avec des modèles existants (AED, BLOOM) ;
• caractériser des espèces clés ( cryptophycées, Uroglena, Mougeotia, Planktothrix ) selon les stratégies planctoniques C, S et R, en fonction de conditions abiotiques variables.

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PROFIL RECHERCHÉ :

I. Conditions d'exercice
La personne recrutée sera préférentiellement basée à Thonon-les-Bains au sein de l'UMR CARRTEL.
Elle sera amenée à se déplacer régulièrement à l'USMB pour discuter et travailler avec les collègues du LAMA. La fréquence de ses visites sera déterminée en fonction des besoins mais elle sera a minima d'une fois par mois. Un bureau et un ordinateur seront fournis à la personne recrutée. Elle aura aussi accès à distance aux machines de calculs du LAMA.
Il est tout à fait envisageable que la personne soit plutôt basée à l'USMB au Bourget du lac -

II. Compétences attendues
Modélisation mathématique appliquée à l'écologie et l'environnement
Connaissance des modèles déterministes basées sur des équations aux dérivées partielles souhaitée
Expérience post- thèse, idéalement en dynamique des populations
Connaissances « planctoniques » souhaitées
Des connaissances en mécanique des fluides seraient un plus
Maitrise de Python ou d'un langage de calcul scientifique ou statistique (Julia, Matlab, R,...)
Connaissances en Fortran (ou C)
Maîtrise des outils de versionnage et de partage de codes (git)
Être familier avec les enjeux de reproductibilité et de science ouverte (ex: principes FAIR)
Être familier avec l'utilisation de Linux

III. Conditions de recrutement
Le recrutement est ouvert aux personnes titulaires d'un doctorat délivré par une université française, ou d'un diplôme reconnu équivalent par l'université, notamment un doctorat ou PhD délivré par une université étrangère.
Contrat de niveau A à durée déterminée du 05/01/2026 au 04/07/2027 à temps plein. Les 2 premiers mois du contrat seront considérés comme période d'essai.
Rémunération brute mensuelle pour le temps plein proposé à partir de 2 638,61 euros

IV. Comment candidater
Transmettre les documents suivants dans un fichier pdf unique nommé CARRTELVERTYCA_NOM PRENOM :
• Curriculum Vitae
• Lettre de motivation
• Copie(s) du ou des diplômes
• Rapport de soutenance de thèse