Ingénieur d'étude en transcriptomique spatiale (f/h)

Ingénieur d'étude en Transcriptomique spatiale (F/H)

L’Institut du Cerveau est une Fondation privée reconnue d’utilité publique dont l’objet est la recherche fondamentale et clinique sur le système nerveux. Sur un même lieu, 1000 chercheurs, ingénieurs et médecins couvrent l’ensemble des disciplines de la neurologie, dans le but d’accélérer les découvertes sur le fonctionnement du cerveau et les développements de traitements sur les maladies comme : Alzheimer, Parkinson, Sclérose en plaques, épilepsie, dépression, paraplégies, tétraplégies, etc.

Le professeur invité Philip De Jager recherche un(e) ingénieur(e) pour travailler sur la plateforme d’histologie de l’Institut du Cerveau.

Cette plateforme est ouverte à l’ensemble des équipes de l’Institut ainsi qu’aux équipes extérieures (académiques ou industrielles). Dotée d’une technologique de pointe, la plateforme est dédiée à l’analyse histologique de tissus biologiques rongeurs et humains, incluant la préparation histologique, différentes procédures de coupes, l’immunohistochimie, l’hybridation in situ, le RNAscope, la microdissection laser, des techniques d’imagerie et d’analyse d’images de pointe. (https://histomics.institutducerveau-icm.org/)

Au sein de la plateforme d’histologie, l’ingénieur(e) d’étude aura en charge des expériences de transcriptomique spatiale. Elle/il réalisera les coupes de tissus, dédiées à cette technologie innovante d’analyse d’expression de gènes. Elle/il effectuera les expériences de transcriptomique spatiale sur des automates de dernière génération, et assurera le suivi et l’interprétation des expériences, en lien étroit avec les plateformes de génomique et de bio-informatiques de l’Institut du Cerveau. Elle/il devra être capable d’interagir avec les équipes de recherche et discuter les résultats en Anglais et en Français.

* Assurer la préparation et la coupe de tissus humains et animaux pour les expériences de transcriptomique spatiale.
* Réaliser les expériences d’immunohistochimie et/ou de colorations histologiques, nécessaires à la sélection de régions d’intérêt pour la transcriptomique spatiale
* Mettre en place des workflows avancés pour la transcriptomique spatiale, par exemple : segmentation d'images, quantification de la distribution de transcrits et/ou protéines
* Réaliser les premières analyses de standards des données de transcriptomique spatiale
* Organiser et contrôler l’utilisation collective des appareillages et des postes de travail
* Maintenir, répertorier et promouvoir les techniques de transcriptomique spatiale, sous la direction des responsables opérationnel et scientifique de la plateforme
* Former les scientifiques à l'utilisation des techniques de transcriptomique spatiale et rédiger des procédures
* Utiliser, maintenir, et développer le système de gestion des informations de laboratoire pour informer les analyses
* Conseiller les utilisateurs sur les possibilités techniques, leurs limites, les méthodes d’analyse, leur interprétation, et en assurer le suivi
* Rédiger des rapports d’expériences ou d’études, des notes techniques
* Travailler en étroite collaboration avec les équipes scientifiques, la plateforme de génomique et d’analyse de données, pour mettre en œuvre des protocoles innovants permettant de localiser et de quantifier, de manière fines, l’expression de gènes ou de protéines.
* Participer aux réunions de projet
* Communiquer sur les avancées des techniques de transcriptomique spatial lors de conférences scientifiques (internes et externes) ou dans des journaux scientifiques
* Assurer l’application des principes et des règles d’hygiène et de sécurité et mettre en œuvre une démarche qualité et un suivi métrologique des équipements
* Assurer la veille scientifique dans ce domaine émergeant
* Licence à Master ou équivalent

Savoir-faire:

* Expérience professionnelle acquise : 3 à 5 ans
* Très bonnes connaissances et technique en histologie (coupes, coloration histologiques et immunohistochimie), et en particulier de l’histologie du système nerveux
* Très bonnes compétences en biologie moléculaire (ISH, RNAscope, FISH…)

Savoir:

* Bonnes connaissances des techniques de génomique (extractions d’ARN, qPCR, RNAseq…)
* Notion en analyse de données souhaitée mais non requise (langage R et /ou Python)
* Très bonne capacité rédactionnelle et de communication scientifique (Anglais et Français)
* Maîtrise des outils informatiques

Savoir-être:

* Autonomie et rigueur
* Excellente capacité d’organisation
* Excellente capacité de travail en équipe multidisciplinaire

Nous nous engageons à lutter contre toute forme de discrimination et garantissons un environnement de travail inclusif et respectueux de toutes les diversités.

Tous nos postes sont ouverts aux personnes en situation de handicap.

Postulez directement sur notre site carrière : envoyez votre CV et lettre de motivation ainsi que les noms et coordonnées de deux personnes référentes capables de commenter votre parcours et qui ont accepté d’être contactées, dans un même document pdf : https://offres.institutducerveau-icm.org/fr/jobs/1967-21


Technicien de Laboratoire en Anatomie et Cytologie Pathologiques H/F


Ingénieur d'étude/ Assistant Ingénieur entrainement comportemental et anesthésies PNH


Technicien de Laboratoire - Paris 14E - CDD Évolutif H/F


Technicien de laboratoire (H/F) – Paris 14e – CDD évolutif


Responsable d\'Accréditation - Ingénieur Biologie


Technicien de Laboratoire / Coordinateur d\'Accréditation


Technicien de laboratoire ( La pitié Salpêtrière ) F/H


Technicien de laboratoire ( Bichat ) F/H


Technicien Création (Laboratoire Parfumerie) H/F / Assistant Parfumeur H/F


Stage - Assistant(e) Communication Scientifique- Shiseido EMEA H/F - janvier 2026

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