Organisation 3D du génome et régulation de l'expression des gènes en réponse au signaux mécaniques".
Projet collaboratif et interdisciplinaire : Biologie et Physique en partenariat avec le laboratoire de physique théorique de Toulouse (LPT).
Résumé du projet :
Toutes les cellules des organismes mammifères partagent le même génome issu des deux gamètes parentaux. Malgré cette identité génétique, la plupart des cellules d'un individu diffèrent. Cela dépend par exemple du tissu ou de leurs fonctions. Ce phénomène est largement contrôlé par la régulation des programmes d'expression des gènes, sur lesquels les signaux environnementaux comme les facteurs de croissance ou les hormones, jouent un rôle essentiel. En plus de ces signaux biochimiques, les cellules répondent à des contraintes physiques : étirement, compression et rigidité de la matrice extracellulaire (MEC). L'élasticité de la MEC, revêt une importance physio-pathologique critique : elle favorise l'invasion tumorale et régule la différenciation de cellules souches. Notre projet a pour but de comprendre comment ces contraintes jouent sur l'organisation 3D de notre génome pour le réguler grâce à des outils de génomique et de le modéliser à l'aide de concepts physique et de simulations de dynamique brownienne. Cet objectif pourrait nous permettre à terme de contrôler ces mécanismes.
Contexte de travail
L'étudiante ou l'étudiant sera encadré par Dr Cyril Esnault (Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier - IGMM, Montpellier) et Dr Manoel Manghi (Laboratoire de Physique Théorique de Toulouse - LPT, Toulouse) sur un projet interdisciplinaire (Biologie/Physique) financé par le CNRS via une bourse 80 primes. Elle ou il sera basé à Montpellier à l'IGMM mais travaillera en étroite collaboration avec les 2 équipes. L'Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier est une unité mixte de recherche CNRS et Université de Montpellier, de 180 personnes reparties en 18 groupes de recherche, 9 services communs (dont 5 mutualisés avec d'autres unité du campus CNRS) et 9 plateformes technologiques et scientifiques. L'IGMM est un institut multidisciplinaire dont les travaux ont un impact international fondamental et appliqué en biologie moléculaire et cellulaire (www.igmm.cnrs.fr).
Nous recherchons une étudiante ou un étudiant motivé et dynamique avec des connaissances à la fois en physique et en biologie pour mener à bien notre projet scientifique qui vise à étudier comment les stimuli mécaniques influence l'organisation du noyau et les programmes d'expression génique.
Informations : https://www.igmm.cnrs.fr/team/transcription-epigenomique/
Contraintes et risques
- Variabilité possible des horaires de travail (soir et/ou week-end)
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