Topic description
Le VIH-1 code plusieurs protéines accessoires qui permettent au virus d'échapper aux mécanismes de restriction de l'hôte et d'établir une infection productive. Parmi celles-ci, la protéine virale Vpr reste l'une des moins comprises, malgré sa remarquable conservation évolutive et sa contribution essentielle à la réplication virale in vivo.
L'objectif de ce projet de thèse est d'élucider comment Vpr contrecarre un mécanisme de restriction basé sur la chromatine, qui régule le positionnement des nucléosomes et médie la répression transcriptionnelle du VIH.
En utilisant un nouveau modèle cellulaire in vitro, qui reproduit de manière unique la stricte dépendance à Vpr observée in vivo, ce projet étudiera comment Vpr surmonte les barrières épigénétiques inhibant l'expression des gènes viraux après intégration. Des résultats préliminaires suggèrent que Vpr est nécessaire pour lever une répression chromatinienne du génome du VIH, offrant une opportunité unique de définir l'interaction entre les voies de régulation de la chromatine virale et cellulaire.
Le ou la doctorant·e mettra en œuvre une combinaison d'approches de virologie moléculaire, de biologie de la chromatine et de génomique fonctionnelle pour définir le mécanisme moléculaire par lequel Vpr module la structure de la chromatine et le positionnement des nucléosomes afin d'activer les provirus silencieux. Ces travaux contribueront à une meilleure compréhension des étapes précoces du cycle de vie du VIH, ainsi que des principes régissant la répression transcriptionnelle et la réactivation des génomes viraux intégrés.
L'étudiant·e rejoindra un environnement de recherche multidisciplinaire et collaboratif, offrant une formation en biologie moléculaire et cellulaire avancée, en épigénétique et en mécanismes de défense antivirale.
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HIV-1 encodes several accessory proteins that enable the virus to evade host restriction mechanisms and establish productive infection. Among them, the viral protein Vpr remains one of the least understood, despite its remarkable evolutionary conservation and essential contribution to viral replication in vivo. The objective of this PhD project is to elucidate how Vpr counteracts a chromatin-based restriction mechanism that regulates nucleosome positioning and mediates transcriptional silencing of HIV.
Using a newly established in vitro cellular model, which uniquely recapitulates the strict Vpr-dependency observed in vivo, the project will investigate how Vpr overcomes epigenetic barriers that inhibit viral gene expression after integration. Preliminary findings suggest that Vpr is required to relieve a chromatin-driven repression of the HIV genome, providing a unique opportunity to define the interaction between viral and host chromatin regulatory pathways.
The PhD candidate will apply a combination of molecular virology, chromatin biology, and functional genomics approaches to define the molecular mechanism by which Vpr modulates chromatin structure and nucleosome positioning to activate silent proviruses. This work will advance our understanding of the early steps of the HIV life cycle and the principles governing transcriptional silencing and reactivation of integrated viral genomes. The student will join a multidisciplinary and collaborative research environment offering training in advanced molecular and cellular biology, epigenetics, and antiviral defense mechanisms.
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Début de la thèse : 01/10/
WEB :
Funding category
Public funding alone (i.e. government, region, European, international organization research grant)
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