Data analyst en génomique – programme acces ap-hp f/h

Vos missions en quelques mots Au sein de l’équipe Analyse et Usage des Données, vous rejoignez un environnement stimulant où la donnée est au cœur de l’innovation et la recherche en santé. Votre mission consiste à analyser, structurer et valoriser les données de santé afin d’en garantir l’exploitabilité, au service de projets à fort impact scientifique et médical. Vous jouez un rôle clé dans la qualification, l’intégration et la valorisation des données génétiques et génomiques issues des plateformes de séquençage, au service de la recherche, de l’innovation et de l’appui au soin. Ces données, à très forte valeur ajoutée, sont particulièrement attendues par la communauté médicale et constitueront le socle d’une nouvelle offre de service. Détails des missions : o Analyser et évaluer la qualité des données génétiques et génomiques issues des logiciels de soin et de recherche ; o Qualifier, normaliser, tracer et structurer les données en vue de leur intégration et de leur réutilisation ; o Définir les besoins de transformation, d’enrichissement et d’annotation pour répondre aux usages de recherche, de pilotage et d’appui au soin ; o Mettre en place des plans de tests et des contrôles qualité adaptés ; o Accompagner les utilisateurs dans la compréhension et l’usage des données, en lien avec les contextes cliniques et scientifiques ; o Documenter les données ainsi que leur cycle de vie au sein des outils de documentation et du catalogue de métadonnées de l’EDS ; o Contribuer à la mise en œuvre des bonnes pratiques de gouvernance, dans le respect des exigences réglementaires, éthiques et de sécurité. Profil recherché Diplôme : ingénieur ou Master 2 en sciences de l’informatique, sciences des données, bioinformatique ou statistiques avec une première expérience dans le domaine médical, en lien avec la génomique Niveau d’étude : Bac5 Niveau d’expérience :3 à 5 ans d’expérience Compétences : • Bonnes connaissances en santé, épidémiologie, médecine, génétique et génomique humaine • Bonnes connaissances en modules bioinformatiques d’analyse et d’interprétation de données de séquençage. • Bonnes connaissances des langages d’analyse de données : Python, R, SQL • Connaissances des outils de visualisation de données (Exemples : Shiny, Streamlit, Altair, Bokeh, …) • Connaissances des frameworks de tests sur données (Great Expectations, Pandera, DBT, …) • Connaissances en bases de données et des technologies du Big Data (NoSQL, SQL, Hadoop, S3, …) • Compréhension des scripts d’automatisation et des pipelines de données • Déontologie, Respect du secret professionnel Prérequis : • Expérience dans le domaine de la donnée, dans le domaine médical en lien avec la génomique • Maîtrise de l’anglais indispensable (écrit et oral) Savoir-faire et savoir être : • Bonne capacité d’analyse et d’écoute • Sens du relationnel, pédagogie et qualités de communicant • Capacité d’adaptation • Force de proposition • Gestion du temps et des priorités