Job details
Job Type
Full-time
Temporary
Contract
Number of hires for this role
1
Full Job Description
Poste ingénieur: sciences des données et apprentissage automatique en imagerie médicale
Contexte :
La maladie de Parkinson (MP) touche environ 150 000 personnes en France et 6.3 millions dans le monde. La MP est la deuxième maladie neurodégénérative après la maladie d'Alzheimer. Parmi ces patients 600 000 sont éligible à la stimulation cérébrale profonde : une technique chirurgicale qui consiste à mettre un pacemaker dans le cerveau lorsque les médicaments ne permettent pas de traiter ces patients. Seulement 3% des patients éligibles bénéficient de cette chirurgie. ReBrain est une startup crée en janvier 2021 par des chercheurs du CHU et de l’Inria qui vise à lever les freins de cette chirurgie en proposant une planification optimale de la chirurgie. La startup était en incubation chez chrysa-link, l’incubateur startup de Aquitaine Science Transfert et passe actuellement dans l’incubateur régional Unitec.
Rebrain a développé le logiciel OptimDBS qui permet de définir les positions optimales des électrodes à partir de l’IRM du patient en se basant sur un modèle d’intelligence artificielle. OptimDBS est aujourd’hui utilisé dans des projets de recherches cliniques de phase 2 et 3 avec des partenaires partout en France et est en cours d’évaluation clinique dans plusieurs centres européens.
Pour une utilisation à grande échelle du logiciel, nous voudrions automatiser la partie segmentation qui est actuellement semi-automatique. L’ingénieur qui sera recruté travaillera en étroite collaboration avec l’équipe de R&D de l’entreprise. Le but est d’adapter des algorithmes déjà existants et les optimiser afin d’améliorer la segmentation automatique des IRMs.
Responsabilités :
- Veille sur les dernières architectures Deep Learning pour la segmentation des IRMs cérébrales.
- Implémentation et comparaisons de différentes approches de segmentation des Landmarks utilisés par le logiciel OptimDBS.
- Comparer les résultats de prédiction avec des segmentations manuelles.
- Intégrer les développements de prédictions dans le logiciel OptimDBS qui est basé sur la plateforme medInria.
- Comparer les prédictions des cibles par les méthodes automatiques et semi-automatiques dans le logiciel OptimDBS.
- Documenter le développement technologique en suivant les règles établies dans la société.
Compétences :
- Titulaire d’une formation supérieure Bac +5 ou plus (Ingénieur/ Master 2 ingénierie mathématique/statistiques/ informatique ou PhD en mathématiques appliqués ou informatique.
- Vous maitrisez les librairies standard d’apprentissage, TensorFlow, pyTorch Scikit-learn.
- Vous avez mené un ou plusieurs projets d’apprentissage par Deep learning.
- Vous maitrisez les languages python et C++.
- Vous avez travaillé sur des images médicales de type DICOM, nifti, hdr, img, ….
- Vous avez une expérience avec la segmentation des images médicales.
- Vous faites preuve d’un esprit d’analyse et de synthèse.
- Vous pouvez travailler dans une équipe multidisciplinaire : cliniciens ; ingénieurs réglementaires ; ingénieurs de développement ; mathématiciens ; stagiaires ; techniciens de radiologie,…
- Vous disposez également d’un bon relationnel et avez le sens de l’organisation.
- Vous êtes force de proposition et vous avez des qualités rédactionnelles.
- Vous souhaitez participer à une aventure entrepreneuriale dans une startup.
Durée du contrat : 18 mois
Date de début prévue : 01/11/2021
Type d'emploi : Temps plein, CDD
Salaire : 2 200,00€ à 2 800,00€ par mois
Avantages :
- Horaires flexibles
Horaires :
- Du Lundi au Vendredi
- Horaires aménageables
- Périodes de Travail de 8 Heures
- Repos le Week-end
- Travail en journée
Télétravail:
- Temporairement en raison du COVID-19
En cliquant sur "JE DÉPOSE MON CV", vous acceptez nos CGU et déclarez avoir pris connaissance de la politique de protection des données du site jobijoba.com.