Offre de thèse: etude intégrative de la cible d'action inédite de la bactériocine rumc1 (h/f)

Informations générales

Intitulé de l'offre : Offre de thèse : Etude intégrative de la cible d'action inédite de la bactériocine RumC1 (H/F)
Référence : UMR5100-PATPOL2-001
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : TOULOUSE
Date de publication : vendredi 20 juin 2025
Type de contrat : CDD Doctorant
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 1 octobre 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : La rémunération est d'un minimum de 2200,00 € mensuel
Section(s) CN : 01 - Interactions, particules, noyaux du laboratoire au cosmos

Description du sujet de thèse

La multiplication des infections bactériennes dues à des agents pathogènes résistants aux antibiotiques représente une menace considérable pour la santé mondiale. En outre, les améliorations apportées aux classes d'antibiotiques existantes n’enrayent pas l'émergence rapide de mécanismes de résistance. Dans ce contexte, les efforts de recherche se concentrent de plus en plus sur l'identification de nouveaux agents antibactériens dotés de mécanismes d'action uniques, une stratégie qui a considérablement stimulé l'intérêt pour les peptides antimicrobiens (AMP) dérivés du microbiote.
Le projet de thèse vise à élucider les propriétés fonctionnelles de RumC1, un AMP produit par Ruminococcus gnavus du microbiote intestinal humain.
RumC1, caractérisé par ses propriétés structurales inédites, a montré une interaction efficace avec la paroi chez le pathogène humain Streptococcus pneumoniae. De plus, RumC1 diminue l'activité métabolique des enzymes de synthèse de la paroi dans des cellules en croissance. Trois axes de recherche complémentaires seront menés pour déchiffrer (i) où et comment RumC1 s'accumule dans la paroi de S. pneumoniae et d'autres espèces bactériennes ; (ii) comment les cellules meurent de l'interaction de RumC1 avec la paroi ; (iii) comment les cellules peuvent résister à la toxicité de RumC1.
Pour atteindre ces objectifs, une approche multidisciplinaire combinant la génétique moléculaire, la biochimie, la chimie et des analyses de microscopie multi-échelle, incluant des techniques d'imagerie de cellules uniques sera développée. Ce large éventail de méthodologies sera conduit de manière experte et complémentaire dans l'équipe d'accueil au LMGM, en partenariat avec deux équipes partenaires du CEA basée à Grenoble pour développer des approches complémentaires de chimie et d'imagerie à super résolution.

Contexte de travail

Le projet sera mené dans l'équipe 'Compétence et Transformation du Pneumocoque' (https:///fr/equipe-polard) au Laboratoire de Génétique et de Microbiologie Moléculaire (LMGM) du Centre de Biologie Intégrative (CBI), sur le campus Paul Sabatier de l'Université de Toulouse.

Contraintes et risques

Une partie des expériences de microbiologie seront réalisée en laboratoire de sécurité de niveau L2