RESPONSABILITÉS :
L'objectif de cette mission sera de développer une approche méthodologique novatrice, permettant la construction de graphes intégrés combinant données culturelles et biologiques, afin de mieux caractériser les dynamiques de diffusion culturelle versus les dynamiques démographiques au cours de l'évolution des populations humaines. Les méthodes développées seront appliquées à divers contextes géo-chrono-culturels ciblés par les chercheurs du GPR Human Past.
Le projet s'inscrit parfaitement dans les objectifs du WP1-Action 3 du GPR Human Past qui propose de démêler les rôles respectifs / combinés des "facteurs environnementaux et socioculturels affectant la variation génétique et phénotypique" des populations humaines.
· Vous développez des méthodes de graphes bio-informatiques
· Vous proposez leur application aux recherches des membres du GPR
· Vous contribuez à la valorisation des travaux par la rédaction d'articles scientifiques
PROFIL RECHERCHÉ :
Titulaire d'un Doctorat en Paléogénomique ou en Bio-informatique, vous avez des connaissances en anthropologie, archéologie, génétique, biologie moléculaire, génomique computationnelle. Vous avez une expérience en analyse des IBD (Iidentical-By-Descent) et en théorie des graphes.
· Vous êtes autonome dans vos travaux et savez travailler en pluridisciplinarité
· Vous êtes à l'aise avec Linux, Shell Bash, Python en particulier les bibliothèques Pandas, NumPy et NetworkX
· La connaissance des logiciels Gephi ou Cytoscape serait un atout notamment pour le partage et la visualisation de graphes avec des collaborateurs
· En paléogénomique, une maîtrise des outils HaploGrep, pathPhynder ou Yleaf pour l'analyse des marqueurs uniparentaux serait appréciée
· Une expérience avec ATLAS et GLIMPSE pour l'imputation, ainsi qu'avec ancIBD, constituerait également un avantage
Vous vous reconnaissez ? Postulez-vite !
Plus d'informations :
La recherche archéologique intègre de manière croissante les approches par graphes et par réseaux, comme en témoigne la création de la communauté « Connected Past » en 2011.
Vous serez encadré par Marie-France DEGUILLOUX et Mélanie PRUVOST.
Basé à Pessac - accès tram B (arrêt « François Bordes ») bus, vélo.
CDD de 12 mois
Salaire mensuel brut : entre 2400€ et 2700€ selon grille et profil
Avantages liés au poste :
50 jours de congés annuels dès la première année
Prise en charge à 75% de l'abonnement aux transports en commun de Gironde
Participation à la mutuelle à hauteur de 15€ / mois
Restauration subventionnée
Des offres loisirs, sport et culture pour tous les personnels
Forfait "mobilités durables" sur trajet domicile – travail
Parcours d'accueil et formations
Processus de recrutement : après la période de publication de l'annonce, nous prendrons contact avec les candidats retenus pour un entretien organisé avec le(s) manager(s) et le chargé de recrutement. Les entretiens auront lieu entre le 11 et le 17 Mars 2026 pour une prise de poste souhaitée au 01/04/26.
Conseil : votre lettre de motivation est lue et nous apporte des éléments complémentaires à votre CV !
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