Le poste Pour ce contrat de travail d'une durée de 2 mois renouvelable, la personne recrutée rejoindra l’équipe « Oncogénèse des sarcomes » dirigée par Frédéric CHIBON. L’équipe cherche à comprendre les mécanismes chromosomiques de l’oncogenèse des sarcomes pléomorphes, caractérisés par une très grande instabilité chromosomique. Mission principale La personne recrutée aura pour missions : · D’analyser les données de variants structuraux identifiés par RNAseq sur les données du TCGA · D’Evaluer la pertinence du marqueur biologique iTRAC pour l’analyse pronostique et prédictive de la réponse au traitement systémique dans les différents types de cancers analysés par le TCGA Activités principales · Développer et appliquer des scripts R · Développer et appaliquer des pipeline d’analyse sur le cluster decalcul du Genotoul · Mettre à jour le GitHub de l’équipe. Spécificité(s) et environnement du poste · Travail sur écran Profil recherché Connaissances · Connaitre la biologie des sarcomes · Connaitre les mécanismes chromosomiques de l’oncogenèse. · Maitriser les statistiques adaptées à ce type d’analyse · Maitriser le langage R · Maitriser le calcule parallélisé sur cluster Savoir-faire · Mener de A à Z un projet d’analyse bioinfomatique · Produire des figures de synthèse adaptées aux messages identifiés. · Ecrire les articles scientifiques présentant les résultats obtenus. Aptitudes · Rigueur scientifique · Esprit critique · Esprit d’initiative Expérience(s) souhaitée(s) · Une expérience en ananlyse bioinformatique de données génomiques tumorales sera appréciée Niveau de diplôme et formation(s) · Bac 5 Minimum · Souhaité dans le domaine de l’oncogenèse Compétences recherchées Biologie des sarcomes Mécanismes chromosomiques de l’oncogenèse R Calcul parallélisé sur cluster Ananlyse bioinformatique Statistiques Éléments nécessaires pour postuler Pour valider votre candidature, nous vous demandons de fournir les éléments suivants, vous devrez télécharger les pièces demandées directement lors de votre inscription. Toute candidature incomplète ne sera pas traitée par nos services. Document(s) : Curriculum Vitæ Lettre de motivation 31000 Toulouse, Haute-Garonne, Occitanie
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