: ingénieur d'études en microbiologie (h/f)

Informations générales

Intitulé de l'offre : : Ingénieur d'études en microbiologie (H/F)
Référence : UMR7267-JULVER-001
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : POITIERS
Date de publication : lundi 1 septembre 2025
Type de contrat : IT en contrat CDD
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 2 mars 2026
Quotité de travail : Complet
Rémunération : Salaire brut mensuel entre 2496,98€ et 2879,38€ selon expérience
Niveau d'études souhaité : BAC+5
Expérience souhaitée : Indifférent
BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingenieure ou ingenieur en techniques biologiques

Missions

Le candidat ou la candidate prendra part au projet VORTEX dont l’objectif principal est d’analyser des composés organiques volatils (COV) dans l’air expiré de patients pour développer un outil de diagnostic rapide d'infections respiratoires émergentes (virales et bactériennes). Pour ce poste, la personne recrutée travaillera sur i) la caractérisation du volatilome de souches cliniques de Legionella pneumophila isolées par un partenaire hospitalier, et ii) l’exploration du rôle de certains COV clés au cours du cycle infectieux de la bactérie. Ce deuxième axe comprend notamment une approche métabolomique chez Legionella pneumophila ainsi que l’utilisation de mutants chez cette souche.

Activités

- Culture bactérienne (avec et sans cellules) puis mesure de COV en SPME-GC/MS
- Analyse des chromatogrammes GC et identifications des différents COV
- Création de mutants de délétion de Legionella pneumophila pour des enzymes d’intérêt
- Approche moléculaire de la réponse bactérienne à certains COV (WT et mutants) par PCR et RTqPCR
- Mise en place d’une approche métabolomique non ciblée chez Legionella pneumophila
- Présentation des résultats lors des réunions hebdomadaires

Compétences

Compétences Principales :
- Culture bactérienne et cellulaire
- Utilisation de GC-MS (Formation interne incluse au cours du contrat)
- Biologie moléculaire (extraction ADNs et ARNs, PCR, RTqPCR, optimisation)
- Recommandation par les enseignants ou encadrants sur un savoir être et faire de très bonne qualité
- Rédaction de protocole sur la base de bibliographie existante
- Synthèse de résultats et présentation

Compétences qui constitueront un plus :
- Approche métabolomique chez un modèle procaryote (utilisation de LC-MS et analyse de données)
- Maitrise d’outils bio-informatiques pour l'analyse des données
- Travail en équipe, autonomie

Contexte de travail

Le laboratoire d’Écologie et Biologie des Interactions (EBI) est une Unité Mixte de Recherche (UMR CNRS 7267) de l’Université de Poitiers, rattachée à l’Institut Ecologie et Environnement (InEE) du CNRS dont les thématiques scientifiques s’articulent autour des interactions entre espèces hôtes, microorganismes et facteurs du milieu. Ces thèmes sont abordés par une approche intégrée qui va de la molécule à l’organisme et jusqu’aux écosystèmes.
Le candidat ou la candidate travaillera dans le cadre d’un projet PEPR MIE financé par l’ANRS (VORTEX) sur la mise en place d’une méthodologie permettant la détection et l’identification de pathogènes pulmonaires via l’analyse de COV. Il/elle intégrera l’équipe Microorganismes-Hôtes-Environnements (MHE) du laboratoire et interagira principalement avec le Dr Julien Verdon. Il y aura également des échanges avec plusieurs autres partenaires du projet basés à Lyon. Au cours du contrat, il y aura également des présentations sur l’avancement des résultats à faire devant les différents partenaires, en visioconférence et lors de déplacements à Lyon.

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.

Contraintes et risques

Aucun risque autres que ceux classiquement associés à un travail en laboratoire de microbiologie (exposition à des agents pathogènes de classe 2 donc manipulation en P2; exposition à certains CMR dans les conditions de sécurité imposées par le CNRS)