RESPONSABILITÉS :
CDD d'un an
Le laboratoire de Biochimie et Biologie Moléculaire du CHU de Nîmes comporte trois secteurs fonctionnels : la biochimie générale et spécialisée - hormonologie, la p harmacologie-Toxicologie générale et spécialisée ainsi que la génétique moléculaire.
Laboratoire est labellisé Laboratoire de Biologie Médicale de Référence (LBMR) pour l'oncogénétique somatique, pour la génétique de la Sclérose Latérale Amyotrophique et pour la génétique des Troubles du Spectre Autistique. Il est accrédité ISO 15189.
Certains biologistes participent aux interprétations des génomes sur la plateforme Auragen.
Les activités principales du poste :
1 - Rôle principal :
L'activité de l'ingénieur hospitalier bio-informaticien sera centrée sur le secteur de génétique moléculaire constitutionnelle, dans le cadre du diagnostic de la Sclérose Latérale Amyotrophique :
• soutenir les biologistes dans leur démarche diagnostique, en recherchant et proposant des outils informatiques avancés pour l'analyse des données biologiques.
• développer des pipelines d'analyse bio-informatique afin de traiter les données de séquençage d'exome et de RNA-Seq, fournir des analyses statistiques, mettre en place des outils d'aide à la visualisation des résultats, définir et suivre des indicateurs de performance
• assurer la cohérence et la qualité des résultats
• participer à la rédaction de protocoles et de procédures liés aux analyses bio-informatiques
• participer à la démarche qualité du laboratoire et notamment aux contrôles de qualité EMQN pour l'activité NGS
• participer à la gestion des bases de données
2 - Rôle transversal, au sein du plateau commun de biologie moléculaire
L'ingénieur hospitalier bio-informaticien devra faire le lien entre la DSIH (Direction des Systèmes d'Information Hospitaliers) et le plateau commun de biologie moléculaire :
• participer à la sauvegarde et à l'archivage des données informatiques
• veiller à ce que les données de génétique soient stockées conformément aux normes de confidentialité
• coordonner les projets bio-informatiques polaires
• collaborer avec l'ensemble des laboratoires utilisateurs du plateau commun de biologie moléculaire pour assurer le bon fonctionnement des outils et des infrastructures nécessaires aux analyses bio-informatiques
PROFIL RECHERCHÉ :
Votre profil :
• Vous détenez le DU TIM ou une Licence en Information Médical et des Systèmes d'Information (obtenu ou en cours)
• Vous faites preuve de rigueur, de méthodologie et avez le sens de l'organisation
• Vous êtes capable de travailler en équipe
• Vous faites preuve de discrétion, de disponibilité et savez respecter le secret professionnel et médical
Vos compétences :
• Vous maîtrisez les outils bureautiques (Word, Excel, power point
• Vous maîtrisez (ou à défaut connaissance souhaitable) l es modalités techniques du PMSI
• Vous avez une bonne connaissance du vocabulaire médical
• Vous savez organiser votre travail et hiérarchiser les activités à réaliser
• Vous avez le sens du travail en équipe
• Vous détenez de bonnes aptitudes relationnelles
• Vous avez connaissance du fonctionnement administratif, médico-économique et organisationnel de l'établissement
• Vous avez des connaissances approfondies du milieu médical de l'organisation médicale du système de santé et du vocabulaire médical
• Une connaissance du PMSI de son codage et de ses subtilités est appréciable, tout comme l'articulation avec la T2A et la facturation
• Vous avez une connaissance globale de l'architecture du système d'information
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