Termites cultivateurs de champignons: sources naturelles de composés antimicrobiens et sélectionneurs de bactéries multirésistantes aux antibiotiques. // fungus-growing termites: natural sources of antimicrobial compounds and selectors of multi drug-resis

Topic description

L'objectif principal de ce projet est d'identifier et de caractériser de nouveaux composés bioactifs possédant des propriétés antimicrobiennes dérivés des termites cultivateurs de champignons, et de comprendre les mécanismes écologiques et microbiologiques par lesquels ces insectes influencent la sélection et la persistance de micro-organismes multirésistants (MDR).
Les termites du sous-groupe des Macrotermitinae vivent en symbiose avec des champignons du genre Termitomyces, qu'ils cultivent dans des meules fongiques au sein de leurs termitières. Ce système symbiotique constitue un micro-écosystème complexe où interagissent termites, champignons et communautés microbiennes. Nous émettons l'hypothèse que les termites agissent comme des filtres écologiques et biochimiques, façonnant les communautés microbiennes par l'ingestion, la transformation et l'enrichissement sélectif de micro-organismes dans leur système digestif et dans les meules fongiques. Ce processus pourrait favoriser la sélection de souches résistantes aux antibiotiques tout en stimulant la production de métabolites antimicrobiens contribuant à la stabilité de la symbiose.
Des travaux récents, y compris les nôtres, ont mis en évidence à la fois des activités antimicrobiennes et la présence de bactéries multirésistantes dans les meules fongiques, chez les termites et chez la faune qui s'en nourrit. Le projet vise donc à établir des liens entre symbiose termite–champignon, diversité microbienne et production de métabolites antimicrobiens. Cette hypothèse sera testée grâce à une approche intégrative combinant métabolomique, microbiologie et analyses génomiques afin d'identifier les composés actifs, d'évaluer leurs effets biologiques et de retracer leur origine écologique.
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The main objective of this project is to identify and characterize new bioactive compounds with antimicrobial properties derived from fungus-growing termites and to understand the ecological and microbiological mechanisms through which these insects influence the selection and persistence of multidrug-resistant (MDR) microorganisms.
Termites of the subfamily Macrotermitinae live in symbiosis with fungi of the genus Termitomyces, which they cultivate in fungus combs within their nests. This symbiotic system represents a complex micro-ecosystem where termites, fungi, and microbial communities interact. We hypothesize that termites act as ecological and biochemical filters, shaping microbial communities through the ingestion, transformation, and selective enrichment of microorganisms within their digestive systems and fungus combs. This process may favor the selection of antibiotic-resistant strains while simultaneously stimulating the production of antimicrobial metabolites that contribute to the stability of the symbiotic system.
Recent studies, including our own, have demonstrated both antimicrobial activities and the presence of multidrug-resistant bacteria in fungus combs, termites, and termite-associated fauna. Therefore, this project aims to establish links between termite–fungus symbiosis, microbial diversity, and antimicrobial metabolite production. This hypothesis will be tested through an integrative approach combining metabolomics, microbiology, and genomic analyses in order to identify active compounds, evaluate their biological effects, and trace their ecological origins.
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Début de la thèse : 01/10/

Funding category

Public funding alone (i.e. government, region, European, international organization research grant)

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Concours pour un contrat doctoral