Ingénieur-e en microbiologie

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France.INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.


Environnement de travail, missions et activités

Vous intégrerez l’UMR GenPhySE, unité spécialisée dans l’étude de la génétique, de la physiologie et des systèmes microbiens associés aux animaux d’élevage. Vous travaillerez au sein d’équipes interdisciplinaires mobilisant microbiologie, biotechnologies, analyses moléculaires et écologie microbienne.

Vous bénéficierez d’un environnement composé de plateformes technologiques, d’équipements analytiques avancés et d’un réseau de collaborations internes (INRAE) et externes (notamment pour des activités de développement de biosenseurs).

Votre mission consistera à assurer des activités expérimentales de microbiologie, de biochimie et d’analyses moléculaires au service des projets de recherche menés par l’unité. Vous contribuerez à la mise en œuvre, au suivi et à la validation des protocoles de laboratoire, en interaction avec les chercheurs, ingénieurs et techniciens de l’équipe.

Vous serez plus particulièrement en charge de:

1. Analyses moléculaires: dans le cadre du projet CASDAR CHARME, vous réaliserez des extractions d’ADN à partir d’échantillons microbiens (contenus digestifs). Vous participerez à la préparation des bibliothèques pour séquençage (Illumina ou équivalent) selon les recommandations publiées pour la métagénomique ou l’amplification ciblée visant à relier performances de croissance du porc avec la diversité de son microbiote.

2. Fermentations anaérobies et mesures: Vous mettrez en œuvre des fermentations microbiennes en anaérobiose (cultures discontinues). Vous assurerez la préparation des milieux et du substrat en simulant la digestion haute par le protocole INFOGEST, l’inoculation sous atmosphère contrôlée, le suivi des cinétiques de production métabolique, la traçabilité des conditions expérimentales dans le cadre du projet PHASE FermentEnterotypig. Vous pourrez participer à la mise en place d’une méthode de quantification du lactate par chromatographie liquide haute performance (HPLC). Vous serez impliqué·e dans le développement et l’optimisation de la méthode (colonne, phase mobile, calibration), la préparation des échantillons et l’exécution des analyses.

Vous prendrez en main et utiliserez le système GC déjà opérationnel au laboratoire pour mesurer H₂ et CO₂ produits lors des fermentations en réalisant l’injection des échantillons gazeux.

3. Participation au développement de biosenseurs:Vous contribuerez à des tests expérimentaux, à la validation fonctionnelle et aux mesures réalisées dans le cadre de collaborations. Ces travaux s’appuieront sur le développement réalisé par Ana Zuniga pour détecter le propionate et les acides biliaires et contribueront à caractériser les fermentations anaérobies dans le cadre d’un projet ANR en cours de rédaction.

4. Activités transversales: Vous assurerez la rédaction et mise à jour de procédures (SOP), la tenue rigoureuse des cahiers de laboratoire, la participation aux réunions d’équipe et projets, la formation ponctuelle d’étudiants ou stagiaires sur les méthodes de base.

Une thèse à la suite du contrat pourrait être envisagée.


Formations et compétences recherchées

Licence/Master (Bac+3/5)

Formation recommandée: Master en microbiologie

Connaissances souhaitées: Une formation intégrant des travaux pratiques en anaérobiose ou en chromatographie constitue un atout

Expérience appréciée: Travail dans un environnement de recherche académique ou plateforme technologique.

Aptitudes recherchées:

Capacité à apprendre progressivement des techniques avancées avec accompagnement.

Sens de l’organisation, autonomie croissante et gestion fiable des séries expérimentales.

Goût pour le travail en équipe et les interactions techniques avec chercheurs/ingénieurs.

Capacité à documenter les résultats, tenir un cahier de laboratoire structuré

Motivation pour travailler en anaérobiose et sur équipements analytiques.

Ouverture à des missions ponctuelles en France.


Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez(selon le type de contrat et sa durée) :

- jusqu'à30 jours de congés+ 15 RTTpar an (pour un temps plein)
- d'un soutienà la parentalité : CESUgarded'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences: formation, conseilen orientation professionnelle ;
- d'un accompagnementsocial : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestationsvacancesetloisirs :chèque-vacances,hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activitéssportivesetculturelles ;
- d'unerestaurationcollective.


Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publiquenotamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques.> En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr