Ingénieur détude en bio-informatique - h/f

Ingénieur d’étude en bio-informatique H-F

Équipe de recherche sur la leucémie aiguë myéloïde

U1342- Institut de Recherche Saint-Louis

Unité de Recherche Inserm U1342 située au sein du campus de l’hôpital Saint-Louis à Paris 10ème arrondissement. L’unité travaille principalement sur les cancers hématologiques et surtout les leucémies aigües.


Mission principale

L’agent participera activement à l’analyse bio-informatique des projets de l’équipe dirigée par Camille Lobry au sein de l’unité Inserm U13424. Ces projets ont pour but de comprendre les mécanismes moléculaires impliqués dans le développement des leucémies aiguës myéloïdes. Ces projets feront notamment appel à des technologies de type multi-omics (RNA-sequencing sur cellules en bulk et uniques, ChIP-sequencing, ATAC-sequencing…) et criblage à grande échelle utilisant des banques de shRNA et CRISPR/Cas9.

Activitésprincipales

• Interroger des pipelines déjà établis pour l’analyse de données générées au sein du laboratoire (études transcriptomiques, analyses ChIP-sequencing, d’épissage alternatifs et de criblages shRNA et CRISPR/Cas9)
• Paramétrer des outils, logiciels, systèmes pertinents pour les analyses susmentionnées.
• Rédiger des protocoles d’utilisation des outils et des méthodes mises en place/utilisées.
• Veiller au respect des principes d'accessibilité, d'interopérabilité et de portabilité des données et des outils.
• Développement de nouveaux outils et pipelines d’analyse de données.

Spécificité(s) et environnement du poste

Travail sur ordinateur