Vos missions en quelques mots Missions : Le projet a pour but de caractériser les éléments génétiques mobiles qui influencent la synthese, la biochimie ou la regulation de la capsule extracellulaire et comment ils peuvent impacter les transferts horizontaux chez l’enterobacterie Klebsiella pneumonia Activités : Identification et validation des genes influencent la capsule 1.1Clonage de regulateurs et/ou genes de synthese de la capsule dans des vecteurs d expression 1.2 Quantification de capsule 1.3 Quantification du transfert horizontale Contexte de travail : Le projet sera developpé sous la direction scientifique d’Olaya Rendueles (au CBI-Toulouse). Il s’agit de l’identification et caractérisation de la diversité des element génétique mobiles (MGE) modifiant la capsule. À l'aide de la génomique comparative, nous allons cribler les MGE à la recherche de gènes de capsule et d'éléments régulateurs de la capsule, et identifier les signatures génomiques communes des MGE modifiant la capsule. On validera ensuite expérimentalement l'impact de ces MGE sur la production de capsule de leur hôte et testerons s'ils agissent de manière égoïste pour limiter l'absorption d'autres MGE, restreignant ainsi le flux génétique en raison d'une production de capsule altérée Profil recherché Competences : Savoirs / connaissances Coder en R pour l’analyse de données, techniques classique de microbiologie des populations Savoir générer des mutants chez Klebsiella pneumoniae Savoir analyser des données génomique, incluant l’identification des differents elements génétiques mobiles Savoir-faire Maitrise de l’anglais Redaction d’articles en anglais Implementation et optimisation des protocols de genetique moléculaire Savoirs-être Interagir positivement avec les membres de l’équipe, respect des autres Aider les membres de l’equipe Transmission des connaissance Contraintes et risques : Le travail sera effecttué entierement dans le BSL2, avec une blouse et de gants. La personne devra suivre les formations necessaires pour ceci. Les horaires de travail sont flexibles mais la plupart se deroulera entre 9h30-17h30. De façon exceptionnelle, la personne serait amenée à venir quelques minutes pendant le weekend. Aucun deplacement est envisagé. Niveau d'études minimum requis Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents Spécialisation Formations générales Langues Français Seuil
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