Les phages filamenteux sont des virus qui se comportent comme des symbiotes bactériens. Ils participent notamment à la résistance aux antibiotiques et à la virulence de pathogènes humains et végétaux. Pourtant, le processus d'infection de l'hôte reste mal compris au niveau moléculaire. Le phage fd, infectant spécifiquement Escherichia coli, a servi de modèle pour l'étude de ces virus. Ce phage interagit séquentiellement avec au moins deux structures de l'enveloppe de l'hôte : un pilus conjugatif et le système Tol impliqué dans l'intégrité membranaire et la division cellulaire. Cependant, la manière dont fd se lie à ces structures pour traverser l'enveloppe bactérienne et assurer l'injection de son génome dans l'hôte n'est pas claire. Ce projet financé par l'ANR propose de décortiquer les événements moléculaires et la dynamique du processus d'infection de ces phages.
Activités
Le candidat/la candidate aura pour objectif de caractériser les paramètres moléculaires et dynamiques de l'infection des phages filamenteux, principalement sur le modèle bactérien E.coli. Pour cela, le candidat/la candidate combinera l'utilisation d'approches de microscopie à fluorescence, de biochimie, de biologie moléculaire et de génétique bactérienne.
En parallèle de son projet de recherche, le candidat/la candidate participera à la vie du laboratoire (tâches communes, gestion des stocks et commandes, séminaires internes, diffusion des résultats sous forme de présentations et d'articles).
Compétences
Le candidat/la candidate devra :
- être titulaire d'un doctorat en microbiologie ou biologie cellulaire
- posséder une expérience significative en microscopie à fluorescence : time-lapse, imagerie dynamique, multi-canaux
- Avoir des compétences en analyse d'images (segmentation, tracking cellulaire, quantification spatio-temporelle) et en analyse quantitative de données biologiques.
- Une familiarité avec les approches classiques en biochimie des protéines et biologie moléculaire seraient un plus.
Le candidat/la candidate devra également présenter :
- d'excellentes capacités de communication écrites et orales français/anglais
- une aptitude au travail en équipe et à la collaboration
- un sens de l'organisation
Contexte de travail
Le candidat/la candidate travaillera dans le Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM, UMR 7255, CNRS-Aix-Marseille Université). Il/elle sera intégrée principalement dans une équipe spécialiste des mécanismes de transports à travers l'enveloppe bactérienne et des phages filamenteux. L'équipe comprend un chercheur CNRS, deux enseignant-chercheurs, et deux étudiantes en thèse. Il/elle travaillera en étroite collaboration avec une deuxième équipe du LISM possédant une expertise en biologie cellulaire bactérienne et microscopie à fluorescence.
La date de début prévue est janvier/février 2026, avec une certaine flexibilité.
Le LISM regroupe 8 équipes travaillant sur des thématiques reliées aux membranes bactériennes et les processus qui s'y déroulent. Le LISM appartient à l'Institut de Microbiologie de la Méditerranée (IMM) qui regroupe plusieurs départements (environ 300 personnes travaillant en microbiologie moléculaire et évolutive), des plateformes techniques (protéomique, spectrométrie de masse, transcriptomique, microscopie, production de protéines,).
Le candidat/la candidate travaillera dans le Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Macromoléculaires (LISM, UMR 7255, CNRS-Aix-Marseille Université). Il/elle sera intégrée principalement dans une équipe spécialiste des mécanismes de transports à travers l'enveloppe bactérienne et des phages filamenteux. L'équipe comprend un chercheur CNRS, deux enseignant-chercheurs, et deux étudiantes en thèse. Il/elle travaillera en étroite collaboration avec une deuxième équipe du LISM possédant une expertise en biologie cellulaire bactérienne et microscopie à fluorescence.
La date de début prévue est janvier/février 2026, avec une certaine flexibilité.
Le LISM regroupe 8 équipes travaillant sur des thématiques reliées aux membranes bactériennes et les processus qui s'y déroulent. Le LISM appartient à l'Institut de Microbiologie de la Méditerranée (IMM) qui regroupe plusieurs départements (environ 300 personnes travaillant en microbiologie moléculaire et évolutive), des plateformes techniques (protéomique, spectrométrie de masse, transcriptomique, microscopie, production de protéines,).
Contraintes et risques
Le candidat/la candidate pourra être amené à travailler en laboratoire P2 selon le développement du projet.
Le candidat/la candidate pourra être amené à travailler en laboratoire P2 selon le développement du projet.
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