Nous recrutons un·e chercheur·e postdoctoral·e expérimenté·e (2-3 ans après la thèse) pour étudier les déterminants cellulaires et moléculaires de l’altération de la régénération épithéliale et de la dysfonction de barrière dans les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI: maladie de Crohn, rectocolite hémorragique) et les troubles métaboliques, avec un focus particulier sur l’obésité.
L’objectif central est de développer et de valider un système microphysiologique d’intestin humain-sur-puce (human gut-on-chip), dérivé de matériel de patients et contrôlé sur le plan environnemental, permettant une interrogation fonctionnelle directe de tissus humains. Au-delà de la modélisation d’une physiopathologie pertinente pour la maladie, la plateforme permettra un phénotypage quantitatif et spécifique au patient des altérations épithéliales (p. ex. dynamique des cellules souches/progénitrices, trajectoires de différenciation, intégrité des jonctions, perméabilité, fermeture/réparation des plaies) et soutiendra une stratification fonctionnelle à visée de médecine personnalisée. In fine, l’intestin-sur-puce constituera un cadre ex vivo pour (i) caractériser les altérations fonctionnelles intestinales propres à chaque patient et (ii) évaluer des réponses individuelles à des ‘drug candidates’, afin de prioriser des stratégies thérapeutiques personnalisées visant à restaurer l’intégrité épithéliale et à favoriser la cicatrisation muqueuse.
Le travail intègre des approches humaines complémentaires, incluant des organoïdes intestinaux et colorectaux dérivés de patients, notre plateforme brevetée de microfluidique « intestin-sur-puce », l’édition fonctionnelle du génome, et l’imagerie 3D à haut contenu.
Research project :
We invite applications for an experienced Postdoctoral Fellow (2–3 years post-PhD) to investigate the cellular and molecular determinants of impaired epithelial regeneration and barrier dysfunction in inflammatory bowel diseases (IBD ; Crohn’s disease, ulcerative colitis) and metabolic disorders, with a specific focus on obesity.The central objective is to engineer and validate an environment-controlled, patient-derived intestine-on-chip (gut-on-chip) microphysiological system enabling direct functional interrogation of human patient material. Beyond modelling disease-relevant physiology, the platform will deliver quantitative, patient-specific phenotyping of epithelial alterations (e.g., stem/progenitor dynamics, differentiation trajectories, junctional integrity, permeability, wound closure/repair) and support functional stratification for personalised medicine. Ultimately, the intestine-on-chip will serve as an ex vivo framework to (i) characterise individual patient alterations and (ii) evaluate patient-specific responses to candidate interventions, enabling prioritisation of personalised therapeutic strategies aimed at restoring epithelial integrity and promoting mucosal healing.The work integrates complementary human-relevant approaches, including patient-derived intestinal and colorectal organoids, our in-house microfluidic intestine-on-chip platform, functional genome editing, and high-content 3D imaging.The successful candidate will combine quantitative phenotyping with mechanistic perturbation to resolve the cellular events and signalling networks underlying defective regeneration and barrier failure in IBD and obesity. Expected outcomes include mechanistically grounded biomarkers and actionable targets, as well as a validated experimental pipeline for patient-centric testing of barrier-restoring and pro-regenerative strategies.
CDD 12 mois, renouvelable 2 fois, en temps plein 38h30 hebdomadaires
Structure d'accueil : Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires - U1297 - Délégation Régionale Occitanie Pyrénées
1 avenue Jean Poulhès - 31432 Toulouse Cedex 4
Directeur d'unité : Dominique Langin
Css de rattachement : 3
Responsable d'équipe : Anne BOULOUMIE
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