Rejoignez l'Ifremer pour un océan mieux compris, mieux protégé qui demeure un allié du bien-vivre sur la planète
Des abysses à la surface, de la côte au large, l'Ifremer est l'institut de recherche français entièrement dédié à l'Océan. Ses équipes mènent des recherches, innovent et produisent des expertises pour protéger l'océan, exploiter ses ressources de manière responsable et partager les données marines.
L'Ifremer apporte son expertise scientifique pour éclairer les politiques publiques et élabore des solutions puisées dans l'océan pour répondre aux enjeux de la transition écologique. Opérateur de la Flotte océanographique française avec sa filiale d'armement Genavir, l'Ifremer imagine, conçoit et déploie des moyens technologiques de pointe pour percer les mystères de l'océan.
Rejoignez nos équipes, composées de 1500 scientifiques et métiers supports à la recherche, et présentes sur tout le littoral métropolitain et en Outre-mer.
www.ifremer.fr Date de clôture de réception de candidatures : 27/05/2025
Qui sommes-nous ?
Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer, l'Ifremer contribue, par ses travaux et expertises, à la connaissance des océans et de leurs ressources, à la surveillance du milieu marin et littoral et au développement durable des activités maritimes.
L'Ifremer est source de connaissances, d'innovation, de données de surveillance et d'expertise pour le monde de la mer, à la fois en matière de politique publique et d'activité socio-économique. Il est la seule structure de ce type en Europe.
Fondé en 1984, l'Ifremer est un établissement public à caractère industriel et commercial (EPIC), placé sous la tutelle conjointe des ministères de l'Enseignement supérieur et de la Recherche et de l'Écologie, du Développement durable et de l'Énergie.
Le département IRSI (Infrastructures de Recherche et Systèmes d'Information) est en charge des systèmes d'information - de gestion et de recherche - de l'Ifremer. A ce titre, il assure des services et réalise des projets dans le but de développer, programmer et renouveler l'ensemble des ressources informatiques, matérielles et logicielles, nécessaires :
- Au fonctionnement général de l'Institut, à sa communication, interne et externe, et à la sécurité de ses systèmes d'information ;
- À la mise en oeuvre des infrastructures de recherche dont l'Institut a la responsabilité ;
- À la gestion des données et informations scientifiques que l'Institut acquiert, rassemble, analyse ou diffuse en tant qu'institut national de référence en sciences et technologies marines.
Dans le département IRSI, le service SISMER (Systèmes d'Informations Scientifiques pour le Mer) a pour mission d'exploiter en continu les services de gestion de données couvrant toutes les thématiques des sciences marines, et cela dans le cadre de nombreux projets ou infrastructures d'envergure nationale (Pôle Océan ODATIS de l'IR Data Terra, IR ILICO, etc.), outre-mer (Océan Indien, Nouvelle-Calédonie) et européenne (Services marins Copernicus, SeaDataNet, EMODnet, ENVRI, CERSAT) de gestion de données in-situ et satellite.
Les activités du SISMER s'organisent en pôles autour de plusieurs thématiques toutes indispensables pour la recherche scientifique et la gestion durable des ressources marines. Vous serez placé(e) sous la responsabilité hiérarchique de la responsable du service SISMER et serez membre du pôle Ressources Biologiques et Laboratoires. Les missions de ce pôle sont diverses et incluent :
- L'exploitation de la base de données Harmonie du Système d'Informations Halieutiques SIH (pêche) et la partie biologique de la base de données des échantillons environnement profond BIGOOD ainsi que des outils associés,
- Le déploiement, le suivi et le support des instances Labcollector (LIMS Laboratory Information Management System) dans les laboratoires pour des données de différents types : suivi des échantillons, instruments de laboratoires, etc.
Votre tuteur sera un membre du pôle et vous collaborerez avec le service « Ingénierie des Systèmes d'Informations » (ISI) qui conçoit, développe et fait évoluer les systèmes de gestion de données (logiciels, bases de données, portails de diffusion en ligne, etc.) et qui dispose d'une grande expertise en développements informatiques, bases de données et normalisation technique.
Quelle sera votre mission ?
En tant qu'ingénieur(e) alternant en gestion des données vous interviendrez dans la thématique des Ressources biologiques, halieutiques et des laboratoires,
La mission principale sera de contribuer à l'amélioration de la FAIRisation des données du pôle par l'implication dans différents projets et systèmes d'information.
Les principes FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, and Reusable) font partie des enjeux du SISMER et visent à améliorer la gestion des données scientifiques, et notamment les données marines, ainsi que leur exploitation par des machines.
Il s'agira de développer et mettre en place un ensemble de scripts Python et SQL notamment répondant aux besoins de l'équipe.
Quelles seront vos activités ?
Dans le cadre ci-dessus, les activités principales seront organisées selon plusieurs axes. Le dernier axe plus technique visera à l'amélioration des procédures d'exploitation pour le SIH.
Intégration de données
- Intégration de données en assurant la compatibilité des données avec les référentiels nationaux et internationaux.
- Amélioration des interfaçages entre les différentes bases de données existantes.
Génération de rapports automatisés et développement de tableaux de bord
- Optimisation du suivi de l'assistance auprès des utilisateurs via la mise en place de rapport automatisé et l'utilisation de Python Quarto par exemple
- Finalisation des tableaux de bord existants du SIH puis mise en place pour labcollector en lien avec les attendus de la maîtrise d'ouvrage
Evaluation et amélioration de la FAIRness
- A partir de travaux déjà réalisés au SISMER et des méthodes internationales RDA ou EOSC, évaluer la FAIRness des données du pôle
- Proposer et développer des pistes d'amélioration
Amélioration des procédures d'exploitation
- Etat des lieux des procédures existantes
- Catalogage et descriptions des traitements associés au procédures d'exploitation
- Amélioration de l'existant notamment des outils (ex : automatisation de certaines tâches)
Champs relationnel
En interne :
- Les membres du SISMER et d'ISI impliqués dans les données et problématiques du pôle Ressources Biologiques et Laboratoire
- Les interlocuteurs Ifremer du SIH et autres utilisateurs Ifremer LabCollector notamment
En externe :
Contacts possibles avec les partenaires de projets scientifiques en France ou en Europe, et avec les prestataires informatiques qui développent les évolutions et les correctifs des applications.
Comment se déroulera votre activité ?
- Taux d'activité : 100%
- Périmètre géographique d'intervention : France métropolitaine
- Déplacements : France Métropolitaine
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