Stage - intégration de données clients dans un modèle de rétro synthèse (f/h)

Vous rejoindrez l'organisation BIOVIA R&D qui met au point de nouveaux produits logiciels à destination des industries des sciences de la vie.

L'équipe Bioknowledge est en charge du développement de plusieurs services fournissant des capacités fondamentales aux applications BIOVIA tels des graphes de connaissance scientifique dans le domaine de la biologie, de la chimie et de la médecine. C’est une équipe multidisciplinaire intégrant toutes les compétences de développement logiciel cloud (spécifications fonctionnelles, back-end dev, front-end dev, qualité), un responsable de produits et des compétences en biologie, mathématique. L’équipe s’appuie sur les méthodes Scrum.





Vos Missions







Nous avons développé dans notre équipe Reaction Planner, une application destinée aux chimistes pour les aider dans la rétrosynthèse de molécules d’intérêt (par exemple de nouveaux médicaments). Cet outil utilise notamment un réseau de neurones, LocalRetro, pour inférer des réactions chimiques. Le réseau de neurones a pour l’instant été entraîné sur des bases de données publiques (comme USPTO-50k), mais les clients de BIOVIA pourraient vouloir utiliser leurs propres données qui peuvent contenir des chimies très spécifiques non représentées dans les données publiques et donc non apprises dans nos modèles.

L’objectif du stage est donc de développer une méthodologie d’intégration de ces données clients dans nos modèles de rétrosynthèse en identifiant la meilleure stratégie d’apprentissage.

Qualifications

Le stage nécessite de robustes bases en programmation (python) pour la réalisation de prototypes.
Une bonne connaissance des réseaux de neurones ainsi que des notions de chimie organique sont indispensables.
Le candidat a un Intérêt marqué pour la recherche et le travail exploratoire et fait preuve d’autonomie, de rigueur, de curiosité et de motivation.
Maitrise de l’anglais parlé et écrit indispensable.







Les atouts en nous rejoignant



· Environnement collaboratif et innovant

· Collaboration internationale

· Diversité des technologies, produits et solutions

· Apprentissage au sein d’une équipe experte

· Engagement en faveur de la diversité et de l’inclusion