Ingénieur d’étude en biologie et bio-informatique (h/f)

RESPONSABILITÉS :

INFINITE « Institute for Translational Research in Inflammation » est une unité de recherche mono-équipe de plus de
130 personnes développant une recherche très translationnelle sur l'inflammation et les maladies inflammatoires
chroniques. Sa richesse réside dans sa multidisciplinarité, regroupant des cliniciens et des scientifiques dans les
domaines de l'hépato-gastroentérologie, de la médecine interne et de l'immunologie, de l'épidémiologie, de la pédiatrie
et de la nutrition, de la microbiologie et la biologie cellulaire, de l'intelligence artificielle à la chémoinformatique en
passant par le développement thérapeutique et la biologie moléculaire.

Missions et activités :
L'accès privilégié à des cohortes et des biobanques de patients parfaitement phénotypés, ainsi qu'à des modèles
expérimentaux chez l'homme comme chez l'animal, implique la génération et le besoin d'analyse et d'intégration de
quantités importantes de données et le développement de modèles cellulaires pour tester les hypothèses qui en
découlent. C'est à ce besoin que l'ingénieur va devoir répondre. Pour cela il devra interagir avec les cliniciens et les
biologistes, mais pourra s'appuyer sur des compétences de bio-mathématiques, IA et informatique, chémo/bio-
informatique présentes dans l'unité.

PROFIL RECHERCHÉ :

Activités :
• Choisir, développer et adapter les protocoles de préparation et d'analyse des échantillons biologiques
• Conduire, en adaptant les conditions expérimentales, un ensemble de techniques de biologie cellulaire
• Mettre en place et optimiser les procédures de recueil, de contrôle et de stockage des données clinico-biologiques
et analytiques
• Mettre en place des workflows d'analyse primaire de données Omiques utilisables par les chercheurs de l'unité
• Conduire en autonomie une analyse de données biologiques générées par des approches Omiques
• Effectuer des analyses intégratives sur des ensembles de données Omiques, biologiques et médicales avec les outils
appropriés (par exemple, R, Python)
• Participer à la mise en forme, la présentation et l'interprétation des données analysées
• Diffuser et valoriser des résultats sous la forme de rapports scientifiques et techniques
• Adapter les applications informatiques aux besoins des projets
• Conseiller et former d'autres personnels aux techniques et outils développés
• Définir des procédures qualité et les mettre en œuvre
• Appliquer les règles de déontologie, d'éthique et de bonnes pratiques de laboratoire
• Assurer la veille scientifique dans le domaine
• Collaborer avec les membres de l'unité qu'ils soient cliniciens, biologistes ou spécialiste de l'IA

Compétences :
• Protocoles expérimentaux (connaissance approfondie)
• Recueil, analyse et traitement des données (connaissance approfondie)
• Biologie (connaissance générale)
• Cadre légal et déontologique
• Recueil, analyse et traitement des données (nécessité d'interactions et dialogue avec des biologistes et des
informaticiens)
• Garantir la pertinence des outils d'analyse et des résultats obtenus
• Capacité à transmettre ses connaissances et à présenter ses résultats.
• Autonomie
• Sens critique
• Sens de l'organisation