Chef de projet en en analyse de données - h/f

Chef de projet en en analyse de données QUSBI H/F

U1153 CRESS (Centre de Recherche en Epidémiologie et StatistiqueS)
Equipe OPPaLE (Obstetric, Perinatal, Paediatric Life Course Epidemiology)

Le Centre de Recherche en Epidémiologie et Statistiques (CRESS) est un centre de renommée internationale localisé à Paris et rattaché à l’Inserm, Université Paris Cité, Université Sorbonne Paris Nord et l’INRAe.

Il vise à comprendre les déterminants de la santé des populations aux différents âges de la vie, développer des méthodes innovantes, concevoir et évaluer des interventions pour améliorer les pratiques cliniques et les politiques de santé publique.

Le recrutement s’inscrit dans le cadre d’un projet financé par l’Agence Nationale de la Recherche (ANR) portant sur le développement et l’exploitation de méthodes innovantes d’échographie cérébrale 3D, intégrant des approches avancées de post‑traitement du signal et des images par Deep Learning.

Mission principale

Le projet comprend la réalisation d’une étude clinique prospective multicentrique, menée en collaboration avec 12 centres partenaires en région parisienne et en province.
L’unité INSERM U1153 est située à Paris et associe chercheurs, cliniciens, ingénieurs et personnels techniques dans un environnement fortement translationnel.
Sous la responsabilité du coordinateur du projet ANR (Pr Olivier Baud), la personne recrutée aura pour missions :

Activités principales

• Former et superviser les groupes experts dédiés :
• Au diagnostic 2D/3D des lésions ponctuées de la substance blanche cérébrale (PWML) des prématurés < 30 SA inclus dans l’étude
• A la segmentation manuelle (contours experts utilisés pour la phase d’apprentissage du Deep Learning) des PWML et des structures cérébrales et cérébelleuses étudiées
• Former les référents des services retenus pour l’étude (radiologues, néonatologues) à la réalisation de séquences dynamiques en échographie transfontanellaire 2D utilisables pour la reconstruction de volumes 3D.
• Former les référents des services retenus pour l’étude au processus de pseudonymisation, de transfert de données et de reconstruction 3D
• Participer au monitoring qualité des séquences dynamiques et des reconstructions des volumes 3D
• Former, en collaboration avec l’ingénieur de recherche du laboratoire CREATIS, les référents du groupe expert à l’utilisation de la suite logicielle de segmentation Creatools (outils « maison »)
• Co-réaliser avec le groupe expert dédié les segmentations manuelles des PWML et des structures cérébrales étudiées (ventricules latéraux, thalami, noyaux caudés, noyaux lenticulaires, cervelet)
• Participer à la coordination des investigateurs cliniques et des centres participants, et répondre aux questions techniques (hotline technique)
• Participer à la rédaction des documents scientifiques et réglementaires liés à l’étude clinique
• Participer aux réunions de pilotage du projet et à la vie scientifique de l’unité adaptés aux objectifs scientifiques du projet ANR
• Réaliser des acquisitions d’images (séquences dynamiques et reconstruction 3D du centre d’aval d’appartenance (CH d’Avignon), à 36 SA et à terme)
• Participer en tant que clinicien au développement, à l’optimisation et à la validation des méthodes de traitement et d’analyse d’images réalisées par le laboratoire CREATIS
• Contribuer à la coordination scientifique et au suivi des livrables du projet sous la supervision du coordinateur du projet
• Participer à la vie scientifique de l’unité et aux réunions du consortium ANR
• Assurer une veille scientifique et technologique dans le domaine de l’imagerie