Mission :
Le candidat ou la candidate prendra part au projet EARSCAPE dont le but est d'identifier les pressions environnementales modelant la sensibilité auditive chez l'homme. Dans le cadre de ce poste, le candidat travaillera sur la caractérisation du microbiome de l'oreille, par analyse microbienne du cérumen.
Il/elle travaillera à l'optimisation d'un multiplex métabarcoding afin d'identifier la composante bactérienne, fongique et les traces de plantes présentent dans cette matrice. Pour cela, il/elle réalisera une partie expérimentale qui comprendra le développement et l'optimisation d'une PCR triplex, préparation de librairies, extraction des ADNs à partir du cérumen et analyse post-séquençage. Il/elle travaillera sur la plateforme de la B2M (Biologie moléculaire) du laboratoire.
Activités :
- Extraction ADN à partir de cerumen et quantification ADN (Nanodrop et Qubit)
- Développement et optimisation d'une PCR triplex metabarcoding
- Préparation de librairies
- Quantification ADNs
- Analyse données metabarcoding
- Présentation des résultats lors des réunions hebdomadaires
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