H/f approches phylodynamiques pour maîtriser la propagation du vih

Informations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR8197-VALHER-210 Date de début de diffusion 20/11/2025 Date de parution 07/12/2025 Date de fin de diffusion 11/12/2025 Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Experte / Expert en information statistique Statut du poste Vacant Intitulé du poste H/F Approches phylodynamiques pour maîtriser la propagation du VIH Descriptif de l'employeur Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique. Description du poste Missions : 1. Créer un jeu de données de haute qualité sur le VIH à partir des séquences génomiques disponibles dans les bases de données publiques et des métadonnées associées 2. Reconstruire des arbres ou réseaux phylogénétiques correspondants à ces données (adaptant les méthodes existantes ou développant des méthodes ad-hoc) 3. Développer des approches phylogéographiques/phylodynamiques ciblant ces données Activités : • Développement de nouveaux modèles mathématiques • Développement de méthodes computationnelles et leur implémentation sous forme de logiciels libres • Rédaction scientifique • Communication scientifique Contexte de travail : Le(a) ingénieur(e) rejoindra l’équipe Modelling of Pathogens de l’Institut de Biologie de l’ENS (IBENS), un institut européen de premier plan en sciences de la vie, dédié à la compréhension des mécanismes et des principes fondamentaux qui régissent les systèmes vivants, tant en santé qu’en maladie. L’IBENS est implanté au cœur de Paris. Il regroupe 30 équipes de recherche et plus de 300 personnels spécialisés en génétique et génomique, biologie du développement, neurosciences et écologie & biologie évolutive. Le(a) ingénieur(e) travaillera dans un bureau partagé avec les autres membres de l’équipe et bénéficiera d’un accès complet aux plateformes centrales de l’IBENS, y compris le cluster de calcul. Puisque l’équipe Modelling of Pathogens est une équipe jointe entre l’IBENS et l’Institut Pasteur, le(a) ingénieur(e) sera également co affilié(e) à l’Institut Pasteur et pourra profiter de son environnement scientifique stimulant (par exemple, la possibilité d’assister aux séminaires). Conditions particulières d'exercice Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche. Descriptif du profil recherché Competences : • Solides compétences en programmation (Python, Java ou R) • Maîtrise de l’anglais à l’oral et à l’écrit (niveau B2) • Expérience en développement de logiciels • Expérience dans la mise en place de pipelines d’analyse de données à l’aide d’outils de gestion de workflow (p. ex. Snakemake, Nextflow) • Engagement pour la recherche reproductible (git, conda, etc.) • Connaissances des méthodes et modèles phylodynamiques et/ou phylogéographiques • Connaissance de méthodes d’apprentissage profond Contraintes et risques : travail sur écran Temps plein Oui Rémunération contractuels (en € brut/an) Selon expérience – Entre 3 237 € et 4 960 € Localisation du poste Europe, France, Île-de-France, Paris (75) Géolocalisation du poste PARIS 05 Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 75230 PARIS 05 (France) Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 7 Master/diplômes équivalents Spécialisation Informatique, traitement de l'information, réseau de transmission des données Langues Français (Seuil)