Mission :
L'HolobiomicsLab de l'Institut de Chimie de Nice (ICN), coordonné par le Dr Louis-Félix Nothias, recherche un(e) ingénieur(e) pour developper des méthodes analytique en métabolomique clinique et exposomique. Le poste s'inscrit dans le cadre d'un contrat de recherche collaboratif avec TechInCare, une start-up deep-tech spécialisée dans les applications multi-omiques pour la médecine de précision.
L'ingénieur(e) recruté(e) sera responsable du développement et de la mise en œuvre de workflows analytiques robustes pour les analyses LC-MS/MS et GC-MS d'échantillons cliniques, avec un accent particulier sur la préparation automatisée des échantillons et les méthodologies d'extraction en phase solide (SPE) en ligne. Ce poste offre l'opportunité de travailler à l'interface de la recherche académique et des applications cliniques, contribuant à des approches métabolomiques innovantes avec un impact translationnel direct.
Activités :
1. Développement et optimisation de méthodes
- Concevoir et mettre en œuvre des protocoles automatisés d'extraction d'échantillons pour biofluides et tissus afin d'améliorer la reproductibilité et le débit analytique
- Développer et optimiser l'extraction en phase solide (SPE) en ligne couplée à la LC-MS/MS pour une sensibilité et sélectivité accrues
- Établir des méthodes chromatographiques incluant : (i) Chromatographie liquide en phase inverse (RP-LC). (ii) Chromatographie d'interaction hydrophile (HILIC) ou mixed-mode chromatograhy. (iii) Chromatographie en mode mixte
- Optimiser les paramètres de spectrométrie de masse pour les analyses métabolomiques ciblées et non ciblées
2. Instrumentation et contrôle qualité
- Opérer, maintenir et dépanner les instruments LC-MS/MS et GC-MS (incluant les systèmes Orbitrap)
- Implémenter et maintenir des procédures rigoureuses de contrôle qualité assurant la reproductibilité des données
- Effectuer la calibration de routine et la maintenance préventive des instruments analytiques. Ainsi que le suivi dans le temps des performances.
- Développer et valider des procédures opératoires standard (SOP) pour l'analyse d'échantillons cliniques.
3. Traitement des échantillons et analyse des données
- Exécuter des workflows complets de préparation d'échantillons utilisant des systèmes automatisés de manipulation de liquides
- Maintenir une documentation détaillée sur cahier de laboratoire numérique du développement de méthodes et des protocoles expérimentaux
- Assurer la conformité aux normes de qualité du laboratoire et aux protocoles de gestion des données
4. Activités de recherche collaborative
- Interagir avec des équipes interdisciplinaires incluant chimiste, cliniciens, biologistes et informaticiens
- Contribuer aux publications scientifiques et présenter les résultats lors des réunions d'équipe
- Participer aux activités de formation des étudiants et jeunes chercheurs sur les techniques analytiques
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