Dans le cadre de cette mission, l'ingénieur(e) d'étude sera chargé(e) d'évaluer la capacité de réparation de l'ADN dans des cellules porteuses de mutations identifiées chez des patients, soit via des modèles cellulaires établis, soit directement à partir de PBMC (cellules mononucléées du sang périphérique) issues de patients. Cette analyse sera réalisée au sein de la plateforme PIC-ADN, dédiée à l'analyse de l'instabilité du génome. Elle s'appuiera sur des techniques de référence telles que le western blot et la cytométrie en flux, combinées à une technologie innovante développée au sein de l'équipe, le iCLICK, permettant une détection plus fine et spécifique des défauts de réparation. L'ingénieur(e) contribuera ainsi activement à l'évaluation fonctionnelle de mutations pathogènes dans un contexte à la fois fondamental et translationnel.
Activités
Préparation et culture de modèles cellulaires portant des mutations identifiées chez les patients.
Isolement et manipulation de PBMC (cellules mononucléées du sang périphérique) issues de patients.
Mise en oeuvre de protocoles de western blot pour l'analyse de l'expression et de la régulation des protéines impliquées dans la réparation de l'ADN.
Réalisation de cytométrie en flux, incluant marquages spécifiques et analyses multiparamétriques.
Utilisation et optimisation de la technologie iCLICK, développée dans l'équipe, pour l'évaluation fine de la réparation de l'ADN.
Analyse et interprétation des résultats expérimentaux, en lien avec les mutations génétiques étudiées.
Participation à la gestion des activités de la plateforme PIC-ADN, dédiée à l'analyse de l'instabilité du génome.
Rédaction de comptes rendus d'expérience et contribution aux rapports scientifiques.
Interaction avec les chercheurs, cliniciens et bioinformaticiens dans le cadre de projets collaboratifs.
Compétences
- Rigueur expérimentale et sens de l'organisation, notamment pour la gestion de protocoles complexes et reproductibles. (experience en plateforme ou dans l'industrie)
- Maîtrise des techniques de biologie cellulaire et moléculaire, en particulier culture cellulaire, western blot et cytométrie en flux.
- Expérience dans la manipulation de cellules primaires, notamment les PBMC, et/ou de lignées cellulaires modèles.
- Connaissances solides en biologie de la réparation de l'ADN et des mécanismes d'instabilité génomique.
- Capacité à apprendre et à appliquer des technologies innovantes, telles que la méthode iCLICK développée dans l'équipe.
- Autonomie et esprit d'initiative dans la conduite des expériences et l'interprétation des résultats.
- Capacité à travailler en équipe dans un environnement pluridisciplinaire (chercheurs, cliniciens, techniciens).
- Compétences en analyse de données expérimentales, avec une bonne maîtrise des outils bureautiques et d'analyse (Excel, logiciels de cytométrie, etc.).
- Bonnes qualités de communication écrite et orale, en français et idéalement en anglais scientifique.
- Curiosité scientifique et motivation pour la recherche appliquée en lien avec les pathologies humaines.
Contexte de travail
La mission se déroulera au sein du Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM), un institut pluridisciplinaire reconnu pour son expertise dans les domaines de la biologie du cancer, de la génomique, et des approches translationnelles. L'ingénieur(e) intégrera la plateforme technologique PIC-ADN, spécialisée dans l'analyse de l'instabilité du génome et le phénotypage fonctionnel des défauts de réparation de l'ADN. Cette plateforme, dotée d'équipements de pointe et impliquée dans plusieurs projets collaboratifs à visée diagnostique et thérapeutique, constitue un environnement dynamique et stimulant pour le développement de nouvelles approches technologiques.
L'activité s'inscrira sous la responsabilité scientifique du Dr Christophe Lachaud, chercheur spécialisé dans les mécanismes de réparation de l'ADN, et sous la responsabilité opérationnelle de Lara Lee, ingénieure en charge de la coordination des activités techniques de la plateforme. Le/la candidat(e) travaillera en étroite collaboration avec les membres de l'équipe et les partenaires cliniques et académiques, dans un cadre structurant mêlant recherche fondamentale et application biomédicale. Cette mission s'inscrit dans le cadre d'un projet ANR mené en collaboration avec le C2VN (Centre de Recherche en CardioVasculaire et Nutrition), renforçant la dimension translationnelle et interdisciplinaire du projet.
Contraintes et risques
La mission comporte certaines contraintes organisationnelles liées à la nature expérimentale des travaux. En particulier, les cinétiques précises des protocoles (ex. : traitements cellulaires, marquages, temps de récupération) imposent une gestion rigoureuse du temps et une bonne capacité d'anticipation. Le respect strict des délais expérimentaux est essentiel pour garantir la fiabilité et la reproductibilité des résultats.
Par ailleurs, l'ingénieur(e) sera amené(e) à manipuler des substances potentiellement dangereuses, notamment des agents génotoxiques ou cancérigènes utilisés pour induire des dommages à l'ADN ou pour tester la réponse cellulaire. Ces manipulations nécessitent une connaissance et une application rigoureuse des règles de sécurité biologique et chimique, ainsi qu'une vigilance constante pour travailler dans des conditions sécurisées (sous hotte, équipements de protection individuelle, gestion des déchets, etc.). Une formation préalable aux bonnes pratiques de laboratoire et aux protocoles de sécurité sera assurée si nécessaire.
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