Doctorant en bioinformatique du cancer (h/f)

Informations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR5217-MAGRIC-001 Date de début de diffusion 05/01/2026 Date de parution 10/01/2026 Date de fin de diffusion 26/01/2026 Intitulé long de l'offre Doctorant en bioinformatique du cancer (H/F) Date limite de candidature 26/01/2026 Nature du contrat CDD de 3 ans Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Chercheuse / Chercheur Statut du poste Vacant Intitulé du poste Doctorant en bioinformatique du cancer (H/F) Descriptif de l'employeur Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique. Description du poste Sujet de thèse : Les approches de transcriptomique spatiale offrent aujourd’hui une vision sans précédent de l’organisation des cellules au sein de leur environnement tissulaire. Elles permettent notamment d’identifier des niches cellulaires ou « éco-types » jouant un rôle majeur dans la dynamique tumorale et dans les interactions avec le microenvironnement. Malgré ces avancées, plusieurs défis méthodologiques subsistent : la définition même d’une niche ou d’un voisinage multicellulaire reste floue, l’extraction de ses caractéristiques pertinentes à partir des données géniques demeure complexe, et les études disponibles pour valider les méthodes restent limitées. Les applications cliniques de ces approches en oncologie ne sont par ailleurs qu’à leur début. Cette thèse vise à caractériser les niches cellulaires associées à différents sous-types de cellules tumorales dans l’adénocarcinome pancréatique (notamment les phénotypes basal et classique), à partir de données de transcriptomique spatiale en vrac issues du projet ITMO Cancer ACACIA et de données publiques. Contexte : Le Laboratoire d’Informatique de Grenoble (LIG) est un laboratoire d’envergure, dont les partenaires académiques sont : l’Université Grenoble Alpes, Grenoble INP - UGA, le CNRS et Inria. Le LIG rassemble près de 500 chercheurs, enseignants-chercheurs, doctorants et personnels en support à la recherche. Ils relèvent des différents organismes et sont répartis sur trois sites du LIG : le campus, Minatec et Montbonnot. L’ambition est de s’appuyer sur la complémentarité et la qualité reconnue des 22 équipes de recherche du LIG pour contribuer au développement des aspects fondamentaux de l'informatique (modèles, langages, méthodes, algorithmes) et pour développer une synergie entre les défis conceptuels, technologiques et sociétaux associés à cette discipline. Conditions particulières d'exercice Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche. Descriptif du profil recherché Contraintes et risques : Néant Temps plein Oui Rémunération contractuels (en € brut/an) La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel Localisation du poste Europe, France, Auvergne-Rhône-Alpes, Isère (38) Géolocalisation du poste ST MARTIN D HERES Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 38058 ST MARTIN D HERES (France) Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 7 Master/diplômes équivalents Spécialisation Formations générales Langues Français (Seuil)