Publiée le 17 juin
Mission du poste
Informations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR7654-PHINGH-001 Date de début de diffusion 15/06/2026 Date de parution 16/06/2026 Date de fin de diffusion 06/07/2026 Intitulé long de l'offre Doctorant /(H/F) en intelligence artificielle pour l'ARN Date limite de candidature 06/07/2026 Nature du contrat CDD de 3 ans Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / Métier Recherche - Chercheuse / Chercheur Statut du poste Vacant Intitulé du poste Doctorant /(H/F) en intelligence artificielle pour l'ARN Descriptif de l'employeur Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique. Description du poste Sujet de thèse : Vue d’ensemble du projet Les virus à ARN segmenté, comme le virus de la grippe A, évoluent notamment par réassortiment génétique, un processus permettant de générer de nouvelles combinaisons virales pouvant présenter un potentiel pandémique. Bien qu’un très grand nombre de combinaisons soit théoriquement possible, seules certaines apparaissent réellement dans la nature, suggérant l’existence de contraintes de compatibilité entre segments d’ARN. Ce projet de thèse vise à développer des modèles hybrides mêlant apprentissage statistique et modélisation physique afin d’identifier et prédire les réseaux d’interactions ARN–ARN qui contraignent le réassortiment viral. Le travail combinera l’analyse de larges bases de données de séquences virales, des mesures expérimentales à haut débit sur particules virales individuelles, ainsi que des approches de cartographie structurale des ARN, dans un cadre étroitement intégré entre expérimentation et modélisation computationnelle. Objectifs de recherche Le ou la doctorant(e) développera des modèles probabilistes et génératifs, tels que le Direct Coupling Analysis (DCA) et les Variational Autoencoders (VAE), entraînés sur de grandes bases de données de séquences virales. Le projet intégrera également des contraintes physiques liées à l’énergétique des interactions ARN dans les cadres d’apprentissage statistique. Les prédictions des modèles seront comparées quantitativement à des données expérimentales obtenues par des approches à haut débit, avec une stratégie itérative de raffinement des modèles dans une boucle de type « apprendre–concevoir–tester ». L’objectif global est de construire des modèles prédictifs de compatibilité des génomes viraux capables de simuler des scénarios de réassortiment entre souches émergentes. Collaborations Le projet s’inscrit dans un consortium national interdisciplinaire et impliquera des collaborations étroites avec l’Institut Pasteur pour la virologie de la grippe et la génétique inverse, avec des équipes du CNRS spécialisées dans l’étude structurale des ARN à résolution nucléotidique, ainsi qu’avec des plateformes de microfluidique et de séquençage de particules virales individuelles. Contexte : Nous recherchons un(e) candidat(e) ayant une formation en physique, mathématiques appliquées, biologie computationnelle ou intelligence artificielle, avec de solides compétences en programmation Python, un fort intérêt pour la modélisation probabiliste et l’IA générative, ainsi qu’une motivation à travailler à l’interface entre théorie et expérimentation dans les domaines de la biologie des ARN et de l’évolution virale. Conditions particulières d'exercice Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche. Descriptif du profil recherché Contraintes et risques : NA Temps plein Oui Rémunération contractuels (en € brut/an) 2300,00 € brut mensuel Localisation du poste Europe, France, Île-de-France, Essonne (91) Géolocalisation du poste PALAISEAU Lieu d'affectation (sans géolocalisation) 91128 PALAISEAU (France) Critères candidat Niveau d'études / Diplôme Niveau 7 Master/diplômes équivalents Spécialisation Formations générales Langues Français (Seuil)
