Florimond Desprez est une entreprise indépendante et familiale. Le métier de Florimond Desprez consiste à mettre en oeuvre des ressources génétiques pour créer de nouvelles variétés performantes. Année après année, nous créons donc de nouvelles variétés de betteraves sucrières, de blé, de pomme de terre, et de 6 autres espèces de grandes cultures. Nous proposons aux agriculteurs des variétés performantes, mieux adaptées à leurs attentes agronomiques, industrielles et environnementales. Au sein du Laboratoire de Génétique et Biométrie, le sujet de votre stage est le suivant : Analyse QTL en populations biparentales et GWAS pour la recherche de résistance à divers stress biotiques et abiotiques chez le triticale
Face aux aléas climatiques, le développement de variétés de triticale plus tolérantes aux stress biotiques et abiotiques est de première importance. Le projet FSOV RUSTRIT vise à poursuivre les efforts de recherche sur la compréhension du déterminisme génétique des principales maladies foliaires du triticale que sont les rouilles et l'oïdium, ainsi que la tolérance à la germination sur pied (GSP), facteur très limitant sur cette espèce pouvant affecter l'utilisation de la récolte et dégrader la qualité des lots de semences. Les maladies rouille jaune et oïdium et la GSP, seront analysés à partir d'un panel et/ou de populations biparentales par GWAS et par recherche de QTL.
Durant le stage, qui s'inscrira dans la 3ème année du projet, il s'agira d'effectuer le phénotypage sur site pour la résistance à l'oïdium et pour la GSP puis d'analyser l'ensemble des données de génotypage de 2025 et de phénotypage de 2026 par recherche de QTL et GWAS. Une prise en main du protocole d'analyse sera effectuée sur les données phénotypiques obtenues en 2025.
Les données 2026 à analyser seront les suivantes :
- Rouille Jaune
Phénotypage en 3 sites de la pop BREHAT/RIVOLT de 200 lignées haploïdes doublés
- Oïdium
Phénotypage en 2 sites de la pop TALENTRO/MAXIMAL de 281 lignées haploïdes doublés
Phénotypage en 4 sites dont FD du PANEL de 162 lignées et variétés (notations précocité à épiaison, hauteur, oïdium, autres maladies)
- GSP
Phénotypage en 3 sites dont FD de la pop GRANDVAL/TRIBECA de 203 lignées haploïdes doublés (précocité à épiaison, hauteur, maladies, test de Lerebour pour la résistance à la GSP)
Phénotypage en 3 sites du PANEL
Le stage repose donc sur 3 objectifs :
- Phénotypage oïdium du panel RUSTRIT (et autres maladies si présence), et germination sur pied d'une population biparentale
- Analyser les populations biparentales par recherche de QTL
- Analyser le panel par GWAS
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