L'ingénieur de recherche H/F travaillera sur un projet financé dans le cadre d’une chaire du labex MitoCross. Le projet porte sur la caractérisation de mutants de ribonucléases (RNases) chloroplastiques et mitochondriales chez la plante Arabidopsis thaliana afin de comprendre le rôle de ces enzymes dans le contrôle qualité des ARN des organites. La personne recrutée mettra en œuvre des approches classiques de biologie moléculaire et biochimie des ARN ainsi que des approches de séquençage à haut débit basées sur les technologies Illumina et Nanopore afin de répondre aux objectifs du projet.
Activités
• Mise en œuvre des techniques et méthodes d'analyse en biologie moléculaire et biochimie des ARN (clonages et transgénèse végétale, northern blot, qRT-PCR, gels retards) et de biologie cellulaire (fusion des protéines à la GFP et microscopie confoncale).
• Développer et adapter des protocoles de construction de librairies de séquençage à haut débit Illumina et nanopore
• Analyser, exploiter, valider et interpréter les résultats
• Diffuser et valoriser les résultats
• Transférer ses compétences aux membres de l'équipe
Compétences
- Doctorat requis
- Compétences en biologie moléculaire et biochimie (analyses de l'ADN, ARN et protéines)
- Compétences biologie végétale (culture d'Arabidopsis et transgénèse)
- Compétences en bioinformatique et traitement statistique de données de séquençage haut débit
- Capacité à communiquer en français (niveau C1) ou anglais (niveau C1): compétences rédactionnelles et de communication orale
Contexte de travail
L'ingénieur de recherche H/F rejoindra l'équipe « Contrôle qualité des ARN des organites » à l’institut de Biologie Moléculaire des Plantes du CNRS à Strasbourg. L’IBMP possède une expertise reconnue en biologie moléculaire et cellulaire, génétique, biochimie, et plusieurs plateformes technologiques (analyse génétique, protéomique, imagerie, culture des plantes, etc). L’Institut est situé sur le campus central de l’Université de Strasbourg à 10 minutes à pied du centre-ville, et facilement accessible en transport en commun.
L'ingénieur de recherche H/F rejoindra l'équipe « Contrôle qualité des ARN des organites » à l’institut de Biologie Moléculaire des Plantes du CNRS à Strasbourg. L’IBMP possède une expertise reconnue en biologie moléculaire et cellulaire, génétique, biochimie, et plusieurs plateformes technologiques (analyse génétique, protéomique, imagerie, culture des plantes, etc). L’Institut est situé sur le campus central de l’Université de Strasbourg à 10 minutes à pied du centre-ville, et facilement accessible en transport en commun.
Contraintes et risques
Radioprotection (technique du northern-blot)
Radioprotection (technique du northern-blot)
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