Ingénieur d'études en biologie

Vos missions en quelques mots Mission principale: L’équipe Immunologie Intégrative du Cancer dirigée par le Dr Jérôme Galon (Inserm UMRS1138, Université Paris Cité, Centre de Recherche des Cordeliers) étudie les interactions entre le système immunitaire et le microenvironnement tumoral afin d’identifier de nouveaux biomarqueurs prédictifs de réponse aux immunothérapies. L’ingénieur(e) participera à deux projets centrés sur l’optimisation et l’exploitation du test Immunoscore-IC, visant à renforcer sa standardisation sur différentes plateformes technologiques et à approfondir son intégration analytique grâce à des outils numériques avancés. · Projet 1: Optimisation de l’Immunoscore-IC sur la plateforme COMET et affinage des pipelines computationnels. Transfert et optimisation du test Immunoscore-IC (PD-L1/CD8) sur la plateforme COMET (Lunaphore). Calibration des paramètres de coloration, optimisation des performances analytiques et affinage des scripts R afin d’automatiser la quantification cellulaire, calculer les métriques spatiales et standardiser le score Immunoscore-IC. · Projet 2: Immunoscore-IC classique sur Leica BOND RX et analyse via pathologie numérique. Réalisation et analyse du test Immunoscore-IC classique sur la plateforme Leica BOND RX à partir de cohortes de patients atteints de cancer colorectal ayant reçu différents traitements. Supervision du double marquage PD-L1/CD8, contrôle qualité, numérisation des lames et analyses spatiales via HALO et R. Production de résultats destinés à soutenir les études translationnelles et les publications du laboratoire. Activités principales: · Réaliser, optimiser et valider des colorations IHC automatisées · Numériser et préparer les lames, assurer la gestion et le contrôle qualité des images · Analyser quantitativement les tissus via HALO et R (segmentation, densité, colocalisation, métriques spatiales) · Intégrer et interpréter les données issues des plateformes COMET et Leica · Rédiger, actualiser et documenter les protocoles expérimentaux · Participer à la veille scientifique et aux réunions de suivi de projet Profil recherché Connaissances: · Solides bases en immuno-oncologie et microenvironnement tumoral · Maîtrise des techniques d’IHC automatisée et chromogénique · Connaissance des HALO et d’analyse spatiale · Anglais scientifique lu et écrit Savoir-faire: Optimiser, exécuter et valider des protocoles IHC sur plateformes automatisées · Exploiter des images tissulaires complexes avec des outils d’analyse numérique · Réaliser des analyses quantitatives et statistiques rigoureuses · Collaborer efficacement dans un environnement pluridisciplinaire Aptitudes: · Rigueur scientifique, autonomie et sens du détail · Excellente organisation et gestion des priorités · Réactivité, esprit d’équipe et approche analytique Profil: · Formation en biologie (niveau Bac 5) souhaitée · Expérience confirmée dans l’utilisation des systèmes HALO, COMET et Leica BOND RX Éléments de candidature Personnes à contacter jerome.galon@crc.jussieu.fr