Une offre de thèse concernant l’ingénierie enzymatique est proposée à l’Université d’Orléans à partir de Novembre. Cette thèse fait partie du projet collaboratif “Sweet-ThioPep”, coordonné par le Pr. P. Lafite. Ce projet de recherche combine les expertises en ingénierie de protéine et en biocatalyse de l’ICOA (UMR CNRS / Univ. Orléans, Pr. P. Lafite), en méthodes en bioinformatique structurale à l’US2B (UMR CNRS / Univ. Nantes, Pr. B. Offman) et en synthèse peptidique au laboratoire DCM (UMR CNRS / Univ. Grenoble Alpes, Dr. D. Goyard).
L’objectif du projet Sweet-ThioPep est de développer de nouveaux outils biochimiques comme sondes multivalentes non hydrolysables de lectines ou de glycosides hydrolases. Ces outils seront construits par voie enzymatique, à partir de glycosyltransférases (GT) modifiées par ingénierie génétique. Cette approche de GT chimérique, basée sur une approche de bioinformatique, permettra d'obtenir une librairie de biocatalyseurs conçue pour pouvoir greffer divers sucres sur des acides aminés non naturels portant des fonctions thiols.
La / le doctorant mènera les tâches suivantes :
* Clonage & production des GT chimériques, en se basant sur la méthodologie développée précédemment dans l’équipe. Cette approche s’appuiera également sur des études in silico menées par l’équipe de l’US2B impliquée dans le projet.
* Caractérisation de la spécificité de substrat de ces catalyseurs synthétiques, et détermination de leur structure 3D par cristallographie.
* Détermination de la capacité de ces enzymes modifiées à transférer un sucre choisi sur des acides aminés non naturels synthétisés par le partenaire DCM.
* Comprendre les facteurs d’obtention d’enzymes chimériques, pour étendre ce concept à d’autres GT.
Le / la candidat retenu / e pourra acquérir des compétences en production / purifications de protéines recombinantes, analyses enzymatiques et biologie structurale, ainsi que dans l’utilisation de techniques analytiques en chimie (RMN, Spectrométrie de masse, HPLC).
#J-18808-Ljbffr
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