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Ingénieur en génomique spatiale h/f

Montpellier
CDD
CNRS
Publiée le 26 octobre
Description de l'offre

Nous recherchons des candidats ou des candidates très motivés pour pourvoir deux postes d'ingénieur :
- (Projet 1) : utiliser la génomique spatiale pour étudier les mécanismes qui régulent l'organisation de la chromatine pendant la méiose chez la souris ;
- (Projet 2) : développer des approches de multi-omiques spatiales basées sur l'imagerie afin de visualiser les marques épigénétiques et l'organisation 3D de la chromatine dans des échantillons de Drosophile, de souris et d'humains.
Activités
Les candidats ou les candidates pour le projet 1 seront responsables de :
- l'amplification de bibliothèques oligopaint,
- la réalisation de DNA-FISH,
- la préparation d'étalements/squash de chromosomes à partir de spermatocytes,
- l'acquisition et l'analyse des jeux de données de génomique spatiale.

Les candidats ou les candidates pour le projet 2 seront responsables de :
- la conception et la validation de stratégies multi-omiques spatiales pour imager les marques épigénétiques dans des modèles de cancer.
Compétences
Les candidats ou les candidates pour le projet 1 devront avoir une expertise en microscopie et/ou en biologie moléculaire.
Les candidats ou les candidates pour le projet 2 devront avoir une expérience en biologie moléculaire et en technologies basées sur le séquençage.

Ils ou elles doivent démontrer un fort intérêt pour le travail à l'interface entre la biologie, la bio-informatique et la physique. Le travail impliquera des collaborations actives avec Thomas Robert (CBS, Montpellier), Cédric Maurange (IBDM, Marseille) et Céline Vallot (Institut Curie).
Les postes sont financés par l'Agence Nationale de la Recherche (ANR) (Comore) et le PEPR Cell-ID.

Contexte de travail

Le Centre de Biologie Structurale (CBS) mène des recherches à la pointe de la biologie structurale et de la biophysique, afin de révéler les mécanismes physiques fondamentaux qui sous-tendent l'activité biologique et sa régulation. Le CBS est situé au coeur d'un campus de recherche de renommée mondiale en biologie, dans la ville dynamique de Montpellier, sur la Côte d'Azur.

Notre groupe interdisciplinaire s'intéresse à la compréhension des mécanismes d'organisation et de remodelage de l'ADN, en développant des microscopes de pointe et des outils d'analyse d'images. Nous avons récemment mis au point une nouvelle méthode de génomique spatiale (Hi-M) permettant d'acquérir des dizaines, voire des centaines, d'images en couleur.

Pour plus d'informations: Voir sites Internet nollmannlab.org et www.pepr-cell-id.fr
Publications pertinentes :
Devos, et al., Genome Biology, 2024, vol 25: 47.
Messina, et al. BioRxiv 2024 DOI: 10.11
Espinola, Goetz, et al. Nature Genetics, 2021, 53, pages 477-486.
Cardozo Gizzi, et al., Mol Cell, 2019, 74, Issue 1, p1-222.

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
Le Centre de Biologie Structurale (CBS) mène des recherches à la pointe de la biologie structurale et de la biophysique, afin de révéler les mécanismes physiques fondamentaux qui sous-tendent l'activité biologique et sa régulation. Le CBS est situé au coeur d'un campus de recherche de renommée mondiale en biologie, dans la ville dynamique de Montpellier, sur la Côte d'Azur.

Notre groupe interdisciplinaire s'intéresse à la compréhension des mécanismes d'organisation et de remodelage de l'ADN, en développant des microscopes de pointe et des outils d'analyse d'images. Nous avons récemment mis au point une nouvelle méthode de génomique spatiale (Hi-M) permettant d'acquérir des dizaines, voire des centaines, d'images en couleur.

Pour plus d'informations: Voir sites Internet nollmannlab.org et www.pepr-cell-id.fr
Publications pertinentes :
Devos, et al., Genome Biology, 2024, vol 25: 47.
Messina, et al. BioRxiv 2024 DOI: 10.11
Espinola, Goetz, et al. Nature Genetics, 2021, 53, pages 477-486.
Cardozo Gizzi, et al., Mol Cell, 2019, 74, Issue 1, p1-222.

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
Contraintes et risques

Contrat initial d'une durée d'un an, avec possibilité de renouvellement.
Merci de soumettre un CV avec références.
Aucune expérience minimale requise
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