Mission :
Dans le cadre du projet régional VIP-BZH (cofinancé par l'ANR DIVCLIM), l'ingénieur·e recruté·e apportera son expertise scientifique, technique et analytique à la conduite d'analyses bioinformatiques et omiques visant à évaluer la diversité génétique, la résilience écologique et les capacités d'adaptation de la vipère péliade (Vipera berus) face au changement climatique.
Sous la responsabilité scientifique du porteur de projet et en interaction avec les plateformes (EcogenO, EcoChim) et les partenaires du projet DIVCLIM, l'IR assurera :
• Le pilotage et le suivi de l'acquisition et du traitement des données génomiques, transcriptomiques et métabolomiques.
• La structuration et l'analyse bioinformatique des données issues de séquençages haut débit.
• La gestion, la documentation, l'archivage et la valorisation des données générées.
Activités :
• Planifier et coordonner les campagnes d'échantillonnage de terrain en Bretagne, en lien avec les partenaires locaux habilités.
• Préparer les échantillons (extraction ADN/ARN, QC) pour le séquençage et la métabolomique selon des protocoles établis.
• Développer et exécuter les pipelines bioinformatiques pour l'analyse de données de séquençage (diversité génétique, structure de population, RNAseq, etc.).
• Réaliser les analyses statistiques des données omiques (génomique, transcriptomique, métabolomique).
• Etablir et maintenir une base de données structurée des résultats et métadonnées associées.
• Participer à l'interprétation des résultats dans un cadre évolutif et éco-physiologique.
• Contribuer à la valorisation des résultats scientifiques (rapports, présentations, publications).
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