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Ingenieur d'études en microbiologie et approche multiomique f/h

Mont-Saint-Aignan
INSTITUT POLYTECHNIQUE UNILASALLE
Ingénieur d'études
De 35 000 € à 39 000 € par an
Publiée le 29 mars
Description de l'offre

Dans le cadre d’une création de poste et afin de renforcer l'unité de recherche AGHYLE, nous recherchons un Ingénieur d'études (F/H) en CDD de 12 mois pour le campus de Mont-Saint-Aignan (76), poste à pourvoir dès que possible. Contexte scientifique : Le projet MAMBO s’inscrit dans le cadre du Grand Défi Biocontrôle & Biostimulation (GDBB) et vise à développer une infrastructure nationale pour évaluer l’efficacité des bio-solutions (BC & BS) et comprendre leurs modes d’action à travers des approches multi-omiques à haut débit. MAMBO est un projet collaboratif réunissant des partenaires académiques et des entreprises privées aux expertises complémentaires (modèles, thématiques, développement technique) pour soutenir la recherche et l’innovation. Ses objectifs principaux sont : Évaluer l’efficacité au champ des différentes stratégies de biocontrôle (BC) et de biostimulation (BS) ; Comprendre leurs modes d’action au niveau moléculaire grâce à des approches multiomiques ; Prédire leur efficacité et leurs conditions optimales d’utilisation via la biostatistique et la modélisation. La plateforme MAMBO a pour ambition de contribuer à accélérer l’innovation autour des biosolutions. L’unité AGHYLE est plus particulièrement impliquée en tant que co-porteur du WP3 – « Microbial ecology for monitoring soil and plant health », dont l’objectif est de caractériser la diversité taxonomique et fonctionnelle des microbiotes du sol et des plantes, d’évaluer les impacts des biosolutions sur ces communautés et d’identifier des biomarqueurs microbiens et fonctionnels pertinents pour la santé des agroécosystèmes. L’ingénieur(e) sera intégré(e) à l’unité AGHYLE (UniLaSalle Rouen), reconnue pour son expertise en agroécologie et microbiologie des sols. Il/Elle collaborera étroitement avec les partenaires du consortium MAMBO (INRAE, CNRS, Universités, entreprises) et participera à des échanges réguliers avec les équipes impliquées. Des déplacements ponctuels sur les plateformes partenaires et lors de réunions de consortium sont à prévoir. Missions proposées : Optimisation des protocoles d’enzymomique ciblant les enzymes hydrolytiques clés impliquées dans les cycles biogéochimiques et les interactions de biocontrôle ; Développement et mise en œuvre d’approches méta transcriptomiques pour révéler les voies métaboliques actives et les fonctions biochimiques associées ; Contribution à la mise en place d’une pipeline multiomique intégrée pour l’analyse des échantillons issus de la rhizosphère et de la phyllosphère ; Participation à la standardisation des protocoles HT et à la rédaction des procédures (SOP) ; Gestion et analyse des données générées ; Contribution à la rédaction des livrables scientifiques et des publications. Formation : Master ou école d’ingénieurs en microbiologie, biologie moléculaire, biochimie ou disciplines associées ; Expertise technique : biologie moléculaire, biochimie (en particulier, mesure d’activités enzymatiques dans les sols), microbiologie ; Connaissance des approches omiques (métatranscriptomique, métagénomique, métabarcoding) et des outils bioinformatiques associés (traitement des données, network) ; Bonnes notions en écologie microbienne, sciences du sol, sciences végétales ; Traitement biostatique des données acquises ; Compétences transversales : Rigueur scientifique, autonomie, capacité à travailler en réseau multidisciplinaire ; Aptitude à la rédaction scientifique (protocoles, rapports, publications). Ce que nous proposons : Ce poste est à pourvoir en CDD de 12 mois sur notre campus de Mont-Saint-Aignan (76). Rémunération brute annuelle entre 35,3k€ et 39k€, à définir selon profil. À Amiens, Beauvais, Rennes et Rouen, UniLaSalle, établissement d’enseignement supérieur et de recherche, propose des formations d’ingénieurs post-bac en 5 ans, une formation vétérinaire post-bac en 6 ans (depuis septembre 2022), des bachelors ainsi que des masters dans les domaines de l’agriculture, de l’agroalimentaire, de l’alimentation-santé, de l’environnement, des géosciences, des énergies et du numérique. Labellisé EESPIG (Établissement d'Enseignement Supérieur Privé d'Intérêt Général), UniLaSalle est membre de la Conférence des Grandes Écoles et ses formations d’ingénieur sont habilitées par la CTI (Commission des Titres d'Ingénieur). UniLaSalle fait partie du réseau d’enseignement mondial La Salle constitué de 72 universités et s’appuie sur 260 universités partenaires à l’étranger. L’Institut compte aujourd’hui 4 000 élèves, accompagnés par 632 salariés dont 180 enseignants chercheurs, 40 doctorants et 27 000 alumni. Inauguré en 2008, le campus est situé à Mont-Saint-Aignan, à 15 minutes en bus du centre historique de Rouen. Anciennement connu sous le nom de l’ESITPA, le campus prend le nom d’UniLaSalle à partir de janvier 2016. Il accueille aujourd’hui les formations dédiées aux nouvelles formes d'agriculture, à la valorisation non alimentaire des agroressources ainsi que l'Ecole vétérinaire nouvellement créée.

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