Ingénieur d'études en bioinformatique

Informations générales Organisme de rattachement INSERM - Délégation Régionale Grand Ouest Référence 2025-2125877 Date de début de diffusion 04/12/2025 Date de parution 04/12/2025 Date de fin de diffusion 03/01/2026 Localisation Nantes Cedex 01 Versant Fonction Publique de l'Etat Catégorie Catégorie A (cadre) Nature de l'emploi Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels Domaine / Métier Prévention, conseil et pilotage en santé - Bio informaticienne / Bio-informaticien Statut du poste Vacant Intitulé du poste Ingénieur d'études en Bioinformatique - Descriptif de l'employeur L’Inserm est le seul organisme public français entièrement dédié à la recherche biologique, médicale et en santé des populations. Il dispose de laboratoires de recherche sur l’ensemble du territoire, regroupés en 12 Délégations Régionales. Notre institut réunit 15 000 chercheurs, ingénieurs, techniciens et personnels administratifs, avec un objectif commun : améliorer la santé de tous par le progrès des connaissances sur le vivant et sur les maladies, l’innovation dans les traitements et la recherche en santé publique. Rejoindre l’Inserm, c’est intégrer un institut engagé pour la parité et l’égalité professionnelle, la diversité et l’accompagnement de ses agents en situation de handicap, dès le recrutement et tout au long de la carrière. Afin de préserver le bien-être au travail, l’Inserm mène une politique active en matière de conditions de travail, reposant notamment sur un juste équilibre entre vie personnelle et vie professionnelle. L'Inserm a reçu en 2016 le label européen HR Excellence in Research et s'est engagé à faire évoluer ses pratiques de recrutement et d'évaluation des chercheurs. Description du poste CDD de 24 mois renouvelable - Temps plein Centre de Nantes accessible en transports en commun Niveau Ingénieur d'études, catégorie A Télétravail 2 jours par semaine Congés/RTT : 45 jours par an Structure d'accueil L'unité U1235-TENS (The Enteric Nervous System in gut and brain disorders) a été fondée en 2008 par le Dr Michel Neunlist. Son objectif est d'étudier le rôle du système nerveux entérique dans les troubles intestinaux et cérébraux, du niveau moléculaire au niveau cellulaire jusqu'au niveau du patient. TENS fait partie de la Faculté de médecine de l'Université de Nantes et est physiquement situé sur le campus principal de l'université. A cet endroit, il est aussi physiquement proche de l'hôpital, qui abrite plusieurs services cliniques avec lesquels il collabore (Maladies digestives, Neurologie, Biochimie, Réadaptation Physique et Médicale) Adresse : Faculté de Médecine - 1 rue Gaston Veil 44000 Nantes Description du poste Mission principale La personne recrutée aura pour mission d’analyser les données multi-omiques issues des projets du laboratoire visant à mieux appréhender le rôle des interactions entre le microbiote intestinal et le tube digestif dans le cadre de l’étude de pathologies inflammatoires de l’axe intestin cerveau et dans l’étude de la réponse du tube digestif à des approches thérapeutiques innovantes. L’objectif sera d’analyser à la fois des données de métagénomique et aussi de métranscriptomiques en utilisant et adaptant des programmes d’analyse d’ores et déjà développés au sein de TENS ou en collaboration avec des partenaires académiques. Activités principales · Analyse de données omiques (analyses multi-variées, analyses différentielles, intégration de données multi-omiques) · Analyse de données omiques (analyses multi-variées, analyses différentielles, intégration de données multi-omiques) · Assurer la gestion des données (sauvegardes, stockage) · Assurer la gestion de code (Gitlab) · Veille scientifique · Participation &agra Descriptif du profil recherché Connaissances · Bonne connaissance des approches de bioinformatique et biostatistique pour l’analyse de données omiques à grande échelle · Maîtrise des environnements Linux · Connaissance de différents langages de programmation : R et Python · Maîtrise des outils de gestion de versions des codes source (git, GitLab) · Expérience avec un système de gestion de workflows (Snakemake en priorité) · Expérience avec Slurm dans l’utilisation d’un cluster de calcul haute performance (HPC) serait un plus. · Biologie (connaissances générales) · Anglais scientifique Savoir-faire · Traitement et gestion des données · Interagir avec les biologistes de l’équipe et être en capacité de comprendre leurs attentes · Transmettre ses connaissances Aptitudes · Organisati Localisation du poste Europe, France, Pays de La Loire, Loire Atlantique (44) Lieu d'affectation (sans géolocalisation) Nantes Date de vacance de l'emploi 04/12/2025